Proteobacteria

Псевдомонадота (лат. Pseudomonadota) — переименованно в 2021 г — наиболее многочисленная группа бактерий — 1534 вида или примерно треть от всех известных видов бактерий.

Протеобактерии
Escherichia coli
Научная классификация
Домен: Бактерии Тип: Протеобактерии
Международное научное название
Proteobacteria et al. 1986
Подгруппы
(Альфа-протеобактерии) Rhodospirillales (Бета-протеобактерии) (Gammaproteobacteria) (Гамма-протеобактерии) (Enterobacteriales) (Дельта-протеобактерии) (Myxococcales) (Эпсилон-протеобактерии) (Зета-протеобактерии)
Систематика в Викивидах Изображения на Викискладе ITIS   956120 EOL   311 FW

Протеобактерии является весьма неоднородной группой, в эту группу включены как симбионты эукариот, так и большое число патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, фото- и (хемотрофные) виды бактерий, как автотрофы, так и гетеротрофы. Все протеобактерии грамотрицательны, внешняя мембрана построена из липополисахарида. Группа включает как облигатно, так и факультативно аэробные и анаэробные бактерии. Также отличны типы движения, в группу входят как бактерии, имеющие жгутики, так и неподвижные бактерии и бактерии, имеющие т. н. («скользящий») тип движения.

Морфологически группа также неоднородна: сюда входят и (палочковидные бактерии), и кокки, и спиралевидные бактерии.

Карл Вёзе выделил эту группу в 1987 году и шутливо назвал её «пурпурные бактерии и их родственники». Группа была выделена на основании анализа нуклеотидных последовательностей 16S рРНК, названа в честь древнегреческого бога (Протея), умевшего менять форму по собственному желанию (в названии протеобактерий отражено большое разнообразие биохимических, физиологических и морфологических свойств, присущих этой группе).

На основании правил номенклатуры бактерий, таксон протеобактерии является нелегитимным ввиду отсутствия определённого типового нижнего таксона.

Таксономия

Протеобактерии делятся на классы, обозначенные буквами греческого алфавита: Alpha-, Beta-, Gamma-, Delta- и Epsilonproteobacteria. Деление на классы также произведено на основании анализа 16S рРНК. Классы альфа-, бета-, дельта- и эпсилон-протеобактерий являются монофилитическими. Род  из класса Gammaproteobacteria был перенесён в класс Acidithiobacillia в 2013. Согласно последним данным, этот род парафилетичен по отношению к бета-протеобактериям. Относительно недавно был описан шестой класс — зета-протеобактерии (Zetaproteobacteria), представителем которого пока является единственный вид (выделенный в чистой культуре) — , железоокисляющий нейтрофильный хемолитоавтотроф, впервые обнаруженный около вулкана (Лоихи) в 1996 году.

Альфа-протеобактерии

(Wolbachia)

В класс альфа-протеобактерии включено большое количество фототрофов, также он включает симбионтов эукариот ((Rhizobium)), облигатных внутриклеточных паразитов (риккетсии, (вольбахии)), уксуснокислых бактерий ((Acetobacter), ), бактерий, способных к спиртовому брожению (), метилотрофов ((Methylobacteriaceae)). Предположительный предок митохондрий также происходит из этой группы.

Бета-протеобактерии

Колонии (Burkholderia pseudomallei)

В этот класс входят аэробные и факультативно-анаэробные бактерии. Сюда входят и хемоорганогетеротрофы, и хемолитоавтотрофы (например, нитрификаторы I стадии , (тионовые бактерии) ), фототрофные роды ( и ). Также в эту группу включены возбудители инфекций: (Burkholderia mallei) (возбудитель (сапа)) и (Burkholderia pseudomallei) (возбудитель ), (Bordetella pertussis) (возбудитель (коклюша)) и род (Neisseria) (возбудители менингита и гонореи).

Гамма-протеобактерии

Pseudomonas aeruginosa

В этот класс входят как фототрофные бактерии (например,  — пурпурные серные аноксигенные бактерии), метанотрофы (например, (Methylococcus capsulatus)), так и бактерии, важные с клинической и научной точки зрения — семейства (Enterobacteriaceae), , (Pseudomonadaceae), , и . В эту группу входят такие возбудители особо опасных инфекций: Yersinia pestis, (Francisella tularensis), Haemophilus influenzae, (Legionella pneumophila) и (Vibrio cholerae), а также такой важный с научной точки зрения модельный организм, как Escherichia coli.

Дельта-протеобактерии

, ТЭМ

Эта группа включает такие известные бактерии, как способные к (скользящему движению) и образующие многоклеточные плодовые тела (миксобактерии), так и известные сульфат-редуцирующие бактерии ((Desulfovibrio), , , ) и серобактерии (). Сюда также входят анаэробные железобактерии (). Сюда также входят известные бактерии-хищники рода , облигатные внутриклеточные бактерии рода (Lawsonia), (хемолитотрофы) рода , способные использовать серу и водород в качестве источника энергии. В класс входят как аэробные, так и анаэробные бактерии, факультативные анаэробы не известны в этом классе. Большинство анаэробов способно использовать неорганические акцепторы электрона, осуществляя таким образом анаэробное дыхание. Представители класса играют важную роль в круговороте элементов в природе.

Эпсилон-протеобактерии

Helicobacter pylori

Сюда входит порядок с семействами и (Helicobacteraceae), в том числе важный с геохимической точки зрения род , возбудитель язвы человека Helicobacter pylori. Также сюда входят симбионты пищеварительного тракта жвачных животных .

Филогения протеобактерий

Acidobacteria                               (Gammaproteobacteria)     (syn. "Piproteobacteria")

Примечания

1. The Earth Life Web, The Proteobacteria  (неопр.). Дата обращения: 16 августа 2008. 11 октября 2008 года.
2. Woese C. R. Bacterial evolution (англ.) // ^[англ.]. — ^[англ.], 1987. — Vol. 51, no. 2. — P. 221—271. — PMID 2439888. — PMC 373105.
3.   (неопр.) Дата обращения: 16 августа 2008. Архивировано из оригинала 7 сентября 2008 года.
4. Noel R. Krieg, Don J. Brenner, James T. Staley. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Proteobacteria (англ.). — Springer, 2005. — .
5. Ciccarelli, FD; Doerks, T; Von Mering, C; Creevey, CJ; Snel, B; Bork, P. Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life (англ.) // Science : journal. — 2006. — Vol. 311, no. 5765. — P. 1283—1287. — doi:10.1126/science.1123061. — PMID 16513982.
6. Yarza, P; Ludwig, W; Euzéby, J; Amann, R; Schleifer, KH; Glöckner, FO; Rosselló-Móra, R. Update of the All-Species Living Tree Project based on 16S and 23S rRNA sequence analyses (англ.) // Systematic and applied microbiology : journal. — 2010. — Vol. 33, no. 6. — P. 291—299. — doi:10.1016/j.syapm.2010.08.001. — PMID 20817437..
7. Williams, KP; Kelly, D.P. Proposal for a new class within the phylum Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., with the type order Acidithiobacillales, and emended description of the class Gammaproteobacteria (англ.) // International journal of systematic and evolutionary microbiology : journal. — 2013. — Vol. 63, no. Pt 8. — P. 2901—2906. — doi:10.1099/ijs.0.049270-0. — PMID 23334881.
8. Williams, K. P.; Gillespie, J. J.; Sobral, B. W. S.; Nordberg, E. K.; Snyder, E. E.; Shallom, J. M.; Dickerman, A. W. Phylogeny of Gammaproteobacteria (англ.) // ^[англ.]. — ^[англ.], 2010. — Vol. 192, no. 9. — P. 2305—2314. — doi:10.1128/JB.01480-09. — PMID 20207755. — PMC 2863478.
9. Genus Mariprofundus : [англ.] // ^[англ.].
10. Emerson D., Moyer C. L. Neutrophilic Fe-oxidizing bacteria are abundant at the Loihi Seamount hydrothermal vents and play a major role in Fe oxide deposition. (англ.) // Applied and environmental microbiology. — 2002. — Vol. 68, no. 6. — P. 3085—3093. — PMID 12039770. [исправить]
11. [1] от 2 мая 2008 на Wayback Machine The versatile [epsi]-proteobacteria: key players in sulphidic habitats : Abstract : Nature Reviews Microbiology

См. также

• (Систематика бактерий)
• (Halomonas titanicae)
• (Bartonella rochalimae)
• (Salinarimonas)

Ссылки

• Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) : Version 2.0 : [англ.] // LPSN. — 2016. — 2 October.