Водородная связь

Водородная связь — форма ассоциации между электроотрицательным атомом и атомом водорода H, связанным ковалентно с другим электроотрицательным атомом. Характерными примерами таких электроотрицательных атомов являются атомы элементов второго периода периодической системы — азота, кислорода и фтора, а также атомы некоторых других элементов с высокой относительно водорода электроотрицательностью. Водородные связи могут быть межмолекулярными или (внутримолекулярными).

Пример межмолекулярных водородных связей

Природа

Ранее водородную связь рассматривали как электростатическое взаимодействие, усиленное небольшим размером водорода, которое разрешает близость взаимодействующих диполей. Тогда об этом говорят как о разновидности (донорно-акцепторной связи), невалентном взаимодействии между атомом водорода H, ковалентно связанным с атомом A группы A–H молекулы RA–H и электроотрицательным атомом B другой молекулы BR' (или функциональной группы той же молекулы). Результатом таких взаимодействий являются комплексы RA–H···BR′ различной степени стабильности, в которых атом водорода выступает в роли «моста», связывающего фрагменты RA и BR′.

Особенностями водородной связи, по которым её выделяют в отдельный вид, является её не очень высокая прочность, её распространенность и важность, особенно в органических соединениях, а также некоторые побочные эффекты, связанные с малыми размерами и отсутствием дополнительных электронов у водорода.

В настоящее время с развитием квантовохимических расчетов в рамках теории молекулярных орбиталей водородная связь рассматривается как частный случай ковалентной с делокализацией электронной плотности по цепи атомов и образованием трёхцентровых четырёхэлектронных связей (например, –H···[F–H···F]–) или даже четырехцентровых пятиэлектронных связей (в случае образования бифуркатных связей ).

История

В книге The Nature of Chemical Bond and the Structure of Molecules and Crystals (Лайнуса Полинга), впервые изданной в 1939 году, первое упоминание водородной связи приписывается Муру и Винмиллу. Они использовали водородную связь, чтобы обосновать факт, что (гидроксид триметиламмония) является более слабым основанием, чем (гидроксид тетраметиламмония). Описание водородных связей в воде было сделано в 1920 году Латимером и Родебушем.

Свойства

Энергия водородной связи значительно меньше энергии обычной ковалентной связи (не превышает 40 кДж/моль для нейтральных комплексов и 160 кДж/моль для ион-молекулярных комплексов). Однако этой энергии достаточно, чтобы вызвать ассоциацию молекул, то есть их объединение в (димеры) или более крупные (кластеры). Именно ассоциация молекул служит причиной аномально высоких температур плавления и кипения таких веществ, как (фтороводород), вода, аммиак. Связь этого типа, хотя и слабее ионной и ковалентной связей, играет очень важную роль во внутри- и межмолекулярных взаимодействиях. Водородные связи во многом обусловливают физические свойства воды и многих органических жидкостей (спирты, карбоновые кислоты, (амиды карбоновых кислот), сложные эфиры). Прочность водородной связи (энтальпия образования комплекса) зависит от полярности комплекса и колеблется от ~ 6 кДж/моль для комплексов молекул галогеноводородов с инертными газами до 160 кДж/моль для ион-молекулярных комплексов (AHB)^±; так, для комплекса (H₂O•H•OH₂)⁺, образованного H₂O и H₃O⁺ — 132 кДж/моль в газовой фазе.

В воде

Механизм Гротгуса

Основная статья: (Механизм Гротгуса)

Аномально высокая (теплоёмкость) воды, а также теплопроводность многоатомных спиртов обеспечивается многочисленными водородными связями. Одна молекула воды может образовать до четырёх классических водородных связей с соседями (с учётом бифуркатных H-связей до 5—6).

Водородные связи повышают температуру кипения, вязкость и поверхностное натяжение жидкостей. Они ответственны за многие другие уникальные свойства воды.

Водные кластеры

Водородная связь между молекулами воды обозначена чёрными пунктирными линиями. Жёлтые линии обозначают ковалентную связь, которая удерживает вместе атомы кислорода (красный) и водорода (серый).

Основная статья: (Водный кластер)

Согласно современным представлениям, наличие водородных связей между молекулами воды приводит к возникновению так называемых (водных кластеров) или комплексов. Простейшим примером такого кластера может служить :

${\displaystyle {\mathsf {(H_{2}O)_{2}}}={\mathsf {H_{2}O}}\cdots {\mathsf {HOH}}}$

Энергия водородной связи в димере воды составляет 0,2 эВ (≈ 5 ккал/моль), что всего на порядок больше, чем характерная энергия теплового движения при температуре 300 К. В то же время энергия ковалентной связи O–H в 200 раз больше тепловой энергии. Таким образом, водородные связи относительно слабы и неустойчивы: предполагается, что они могут легко возникать и исчезать в результате тепловых флуктуаций. Это, в частности, приводит к тому, что вода должна рассматриваться не как «простая», а как «связанная жидкость»: вода представляется как сеть молекул ${\displaystyle {\mathsf {H_{2}O}}}$, соединённых водородными связями.

В нуклеиновых кислотах и белках

Водородная связь в значительной мере определяет свойства и таких биологически важных веществ, как белки и нуклеиновые кислоты. В частности, элементы (вторичной структуры) (например, α-спирали, (β-складки)) и (третичной структуры) в молекулах белков, РНК и ДНК стабилизированы водородными связями. В этих макромолекулах водородные связи сцепляют части той же самой макромолекулы, заставляя её (сворачиваться) в определённую форму. Например, двойная спиральная структура ДНК определяется в значительной степени наличием водородных связей, сцепляющих пары нуклеотидов, которые связывают одну комплементарную нить с другой.

В полимерах

Многие полимеры усилены водородными связями в их главных цепях. Среди синтетических полимеров самый известный пример — нейлон, где водородные связи играют главную роль в кристаллизации материала. Водородные связи также важны в структуре полученных искусственно полимеров (например, целлюлозы) и в многих различных формах в природе, таких как древесина, хлопок и лён.

В твердом теле

Для твердого тела в настоящее время разработан математический аппарат - метод расчета и анализа (поверхности Хиршфельда), позволяющий точно оценивать вклад водородных связей в межмолекулярные взаимодействия. Применение этого метода позволяет также количественно сравнивать вклады различных типов межмолекулярных взаимодействий друг с другом.

В биологических системах

При формировании биологических мембран (особенно фосфолипидных) в клетках водородные связи играют определяющую роль, обеспечивая их векторность (направленность внешней поверхности мембран в сторону водной среды — субстрата).

См. также

• Химическая связь
• (Фолдинг белка)

Примечания

1. Определение по IUPAC  (неопр.). Дата обращения: 5 мая 2011. 19 марта 2008 года.
2. Афанасьев А. В., Белова Е.В., Герман К.Э., Новиков А.П. Номенклатура, электронное строение органических соединений и новые подходы к оценке их реакционной способности. — М.: Издательский дом "Граница", 2022. — С. 89-109. — 110 с. — . 17 февраля 2023 года.
3. Энергия связи H···N = 8 кДж/моль, связи H···O — около 21 кДж/моль, связи H···F около 36 кДж/моль [1] от 22 сентября 2011 на Wayback Machine. Для сравнения, энергия ковалентной связи — 400—900 кДж/моль [2] от 18 сентября 2010 на Wayback Machine
4. Например, водородными связями обусловлена форма молекулы ДНК
5. T. S. Moore and T. F. Winmill. The state of amines in aqueous solution (англ.) // J. Chem. Soc.. — 1912. — Vol. 101. — P. 1635—1676. — doi:10.1039/CT9120101635.
6. Wendell M. Latimer, Worth H. Rodebush. POLARITY AND IONIZATION FROM THE STANDPOINT OF THE LEWIS THEORY OF VALENCE. (англ.) // J. Am. Chem. Soc.. — 1920. — Vol. 42. — P. 1419–1433. — doi:10.1021/ja01452a015.
7. Association (англ.). IUPAC Compendium of Chemical Terminology, 3rd ed.. (doi):10.1351/goldbook.a00472. Дата обращения: 5 февраля 2024. 5 февраля 2024 года.
8. Dominik Marx. Proton Transfer 200 Years after von Grotthuss: Insights fromAb Initio Simulations (англ.) // ChemPhysChem. — 2006. — Vol. 7. — P. 1848—1870. — doi:10.1002/cphc.200600128.
9. K. A. Zagidullin, A. P. Novikov, D. A. Zelenina, M. S. Grigoriev, K. E. German. Synthesis, crystal structure and Hirshfeld surface analysis of bis­(caffeinium) hexa­chlorido­platinum(IV) in comparison with some related compounds (англ.) // Acta Crystallographica Section E: Crystallographic Communications. — 2023-06-01. — Vol. 79, iss. 7. — P. 644–647. — ISSN 2056-9890. — doi:10.1107/S2056989023005157. 3 ноября 2023 года.
10. Афанасьев А. В., Белова Е.В., Герман К.Э., Новиков А.П. Номенклатура,электронное строение органических соединений и новые подходык оценке их реакционной способности - Учебное пособие (рус.). — M.: [[Издательский дом "Граница" (издательство)|]], 2022. — 110 с. — .

Литература

• Химическая Энциклопедия. Советская Энциклопедия. — М., 1988.
• В. В. Москва. Водородная связь в органической химии. Соросовский образовательный журнал, 11999,N 2, с.58-64 [3] от 7 сентября 2011 на Wayback Machine
• Пиментел Дж., О. Мак-Клеллан. Водородная связь, пер. с англ.. — М., 1964.
• Эпштейн Л.М, Шубина Е.С. Многоликая водородная связь // «Природа». — 2003. — № 1.
• Водородная связь. Сб. ст.. — М., 1964.
• Pauling L. The chemical bond. — N. Y., 1967.

Ссылки

• Водородная связь — статья из энциклопедии «Кругосвет»
• Водородная связь / Иогансен А. В. // Большая советская энциклопедия : [в 30 т.] / гл. ред. А. М. Прохоров. — 3-е изд. — М. : Советская энциклопедия, 1969—1978.