Гаплогруппа R (мтДНК)

Не следует путать с (Гаплогруппа R (Y-ДНК)).

Гаплогруппа R — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

Гаплогруппа R
Тип	мтДНК
Время появления	55 тыс. лет назад
Место появления	Юго-западная Азия
Предковая группа	N
Сестринские группы	(A), S, (X), (Y), (N1), (N2)
Субклады	(B), (F), (R0), , (P),
Мутации-маркеры	12705, 16223

Происхождение

Гаплогруппа R является потомком макрогруппы N и по древности, широте распространения и количеству групп-потомков сама может быть названа макрогруппой. Вероятно, возникла на Ближнем Востоке вскоре (всего через несколько тысяч лет) после заселения его людьми (около 55 тыс. л. н.). В дальнейшем из этого региона была осуществлена экспансия, так что носители группы R (зачастую вместе с другими субкладами группы N) распространились: на юг в Аравию и северо-восточную Африку, на восток по Иранскому нагорью, далее в Центральную Азию до Алтая и на Индостан, на север в Анатолию, на Кавказ и далее в восточную Европу.

Субклады R5, (R6), (R7), R8, R30, R31 являются автохтонными гаплогруппами в Индии. В наборе данных по Центральной Азии (Comas et al. 2004) из 232 линий только 2 принадлежат к R5.

К потомкам этой группы относятся (B), (и её потомки U и (K)), (F), (R0) (и её потомки (HV), H, и (V)), а также (и её потомки (JT), (J) и (T)).

Миграции мтДНК

Палеогенетика

Митохондриальная гаплогруппа R* была обнаружена у палеосибиряка из Усть-Ишима ((Усть-ишимский человек)), жившего 45 тыс. лет назад, но в 2016 году команда Позника классифицировала у усть-ишимца митохондриальную гаплогруппу U*.

Гаплогруппу R определили у представителея культуры ^[англ.] из пещеры ^[нем.] ((Ранис), Тюрингия), жившего около 45 тыс. лет назад.

Гаплогруппа R определена у позднепалеолитического образца CC7-2289 (ок. 44 тыс. л. н.) из пещеры (Бачо Киро) в Болгарии

К гаплогруппе R* относится митохондриальный геном молочного зуба из (it:Grotta di Fumane), найденный в слое возрастом 41 110 — 38 500 лет (протоориньяк).

У останков девушки Пальиччи 23 (en:Paglicci 23) из итальянской пещеры (Пальиччи) возрастом около 28 тыс. лет была обнаружена кембриджская эталонная последовательность (en:Cambridge Reference Sequence) HVR1, указывающая на то, что индивидуум имел либо митохондриальную гаплогруппу R, либо митохондриальную гаплогруппу H. Анализ ДНК кроманьонца Paglicci-12, жившего около 24 тыс. лет назад, показал, что он принадлежал к митохондриальной гаплогруппе R.

У обитательницы Афонтовой горы AG-3, жившей 16 930—16 490 лет назад, была обнаружена субклада R1b.

R1 определена у образца yak025 (14 865—14 590 лет до н. э.) из пещеры (Khaiyrgas Cave, (дюктайская культура)). У образца Khaiyrgas-1 из Якутии (16,9 тыс. л. н.) определена R1b.

R9c1b определили у образца Qihe3 (11 747—11 356 лет до настоящего времени) из провинции Фуцзянь в Китае.

R2-a* определили у образца AH2 (8205—7756 лет до н. э.) из Тепе Абдул-Хосейн (Tepe Abdul Hosein) в Иране (шахрестан (Нурабад)).

R11 определили у образца NE35 (AR8.9K, ARpost9K, 9131—8770 лет до настоящего времени) из Амурского региона ((Китай)).

R3 обнаружена у представителя неолита Венгрии, жившего ок. 7500 лет назад.

R1b определена у мезолитических обитателей UzOO76, UzOO77_new 7200 л. н. (Южного Оленьего острова).

R1a определили у энеолитических образцов I2055 (Unakozovskaya, 6533 л. н.) и I2056 (Unakozovskaya, 6477,5 л. н.) с Северного Кавказа (Унакозовская пещера на ручье Мешоко).

R1b1 определена у представительницы эстонской культуры боевых топоров SOP002 (2864—2495 лет до н. э.) из могильника ^[эст.] в уезде Ида-Вирумаа.

R1a определили у представителя новосвободненского этапа майкопской культуры I6268 (5564 л. н.) из урочища (Клады) в Адыгее.

R1a1a определили у образца MK5009.A0101 с Северного Кавказа (Marinskaya 5, 4710 л. н.).

R1b1 определена у образца GLZ003 из (Глазково) (Glazkovskoe predmestie), датирующегося возрастом 4519—4417 л. н. (ранний бронзовый век Байкала).

R1a определили у представителей (дарквети-мешоковской культуры (накольчатой жемчужной керамики)) эпохи позднего энеолита.

R1b определена у образца эпохи бронзы Anosovo-1 из Забайкалья (ок. 4 тыс. л. н.).

R1b определили у представителя посткатакомбной лолинской культуры NV3001 (Nevinnomiskiy 3, 3970,5 л. н.) в Калмыкии ((Лола)).

R1b1 определили у образца BIY002.A0101 (III—II века до н. э., саргатский горизонт) из урочища Горная Бития на реке Ишим, расположенного в 8 км к юго-западу от деревни (Нижняя Ильинка) (Омская область).

R+16189 определили у тибетского образца C4568 (Piyangjiweng, префектура Нгари, 2300 л. н.).

R1b1 определили у (таримской мумии) L5213 (2000—1800 л. н.).

R11 обнаружена у неклассифицированного образца KHI001 (средне-поздний бронзовый век) из Восточно-Евразийской степи с Алтая.

R1a определили у образца ALA135 (1876—1636 лет до н. э.) из Телль-Атчана ((Алалах), Турция).

R1b1 определили у представителей (унетицкой культуры) из Чехии I14191 (Czech_EBA_Unetice, 3850 л. н.).

R1b1 обнаружена у образца I3860 (Oy-Dzhaylau III, 3626 л. н.) из среднего-позднего бронзового века Казахстана (Oy_Dzhaylau_MLBA_o).

R9b1a3 определили у образца LayiKD01 (1532—1403 л. н.), R9b1b — у образца QinchangKD14 (1545—1407 л. н.) из Китая (Гуанси-Чжуанский автономный район).

R1a1a обнаружена в образце из могильника Канагех (Kanagegh, Армения) возрастом 1500—1300 лет до нашей эры.

R1b1 обнаружена у обитателя Неркин-Геташена (Nerqin Getashen, Армения), жившего 1400—1200 лет до нашей эры.

У образцов из района периода среднего Элама определены митохондриальные гаплогруппы R2 и R5.

R6 определена у представителя (кобанской культуры) из могильника Заюково-3, расположенного близ села (Заюково) в Баксанском районе Кабардино-Балкарской республики (VIII—VI века до н. э.).

R9 определена у образца из (висячих гробов) из Юньнани.

R30 определили у человека с южноазиатской примесью в 40–50 % с кладбища Ват Комноу (Vat Komnou) в Ангкор-Борее (Камбоджа), жившего в начале 1-го тысячелетия (95%-й доверительный интервал — 78—234 гг., калиброванная дата).

R0a1 определена у образцов с христианского кладбища R (∼650—1000 гг.) на острове ^[англ.] в Северном Судане.

R11a обнаружена у позднесредневекового образца DEC01/SHR001 из Монголии.

R1a1a обнаружена у норвежского образца VK114 из Тронхейма (XII—XIII век).

R9b1b определили у образца HuatuyanNL18 (500 л. н.), R+16189 — у образца HuatuyanNL19 (455—294 л. н.) из Китая (Гуанси-Чжуанский автономный район).

Примечания

1. Malliya gounder Palanichamy et al. Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Implications for the Peopling of South Asia от 5 мая 2021 на Wayback Machine, December 2004
2. SUPPLEMENTARY INFORMATION 8. MITOCHONDRIAL GENOME ANALYSIS  (неопр.). Дата обращения: 23 октября 2014. 24 марта 2016 года.
3. Posnik G. D. et al. (2016) Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences от 28 мая 2017 на Wayback Machine, Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. fig. 15).
4. Dorothea Mylopotamitaki et al. Homo sapiens reached the higher latitudes of Europe by 45,000 years ago от 4 февраля 2024 на Wayback Machine // Nature, 31 January 2024
5. Jean-Jacques Hublin et al. Initial Upper Palaeolithic Homo sapiens from Bacho Kiro Cave, Bulgaria от 19 июня 2020 на Wayback Machine, 11 May 2020
6. Палеогенетические данные подтвердили, что создателями протоориньякской культуры были люди современного типа от 29 апреля 2015 на Wayback Machine, 27.04.2015
7. A 28,000 Years Old Cro-Magnon mtDNA Sequence Differs from All Potentially Contaminating Modern Sequences
8. Ancient DNA  (неопр.). Дата обращения: 1 февраля 2015. 23 апреля 2015 года.
9. Gülşah Merve Kılınç et al. Investigating Holocene human population history in North Asia using ancient mitogenomes от 31 июля 2020 на Wayback Machine, 12 June 2018 // Dataset 1 / Table S4
10. Gülşah Merve Kılınç et al. Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia от 17 июня 2021 на Wayback Machine, 2021
11. Tianyi Wang et al. Human population history at the crossroads of East and Southeast Asia since 11,000 years ago // Cell, June 24, 2021
12. Broushaki F.; et al. (2016 July). "Early Neolithic genomes from the eastern Fertile Crescent". (Science). 353 (6298). doi:10.1126/science.aaf7943. PMC 5113750. PMID 27417496. 22 февраля 2020. Дата обращения: 30 мая 2021. {{}}: Проверьте значение даты: |date= ()
13. R11 MTree
14. Xiaowei Mao et al. The deep population history of northern East Asia from the Late Pleistocene to the Holocene от 28 июня 2021 на Wayback Machine, May 27, 2021
15. Fu. Q. et al. The genetic history of Ice Age Europe, Nature, published online 2 May 2016.
16. Alissa Mittnik et al. The Genetic History of Northern Europe от 25 апреля 2017 на Wayback Machine, 03.03.2017
17. Chuan-Chao Wang et al. The genetic prehistory of the Greater Caucasus от 9 мая 2020 на Wayback Machine, May 16, 2018
18. Lehti Saag, Sergey V. Vasilyev, Svetlana V. Oshibkina et al. Genetic ancestry changes in Stone to Bronze Age transition in the East European plain от 23 января 2021 на Wayback Machine (Table 1), July 03, 2020 (bioRxiv от 30 января 2021 на Wayback Machine)
19. He Yu et al. Paleolithic to Bronze Age Siberians Reveal Connections with First Americans and across Eurasia от 2 июля 2020 на Wayback Machine, May 20, 2020
20. Chuan-Chao Wang et al. The genetic prehistory of the Greater Caucasus от 18 мая 2018 на Wayback Machine, May 16, 2018
21. Guido Alberto Gnecchi-Ruscone et al. Ancient genomic time transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians от 18 августа 2021 на Wayback Machine // Science Advances. Vol. 7, Issue 13, 26 Mar 2021
22. HONGRU WANG et al. Human genetic history on the Tibetan Plateau in the past 5100 years от 22 марта 2023 на Wayback Machine // SCIENCE ADVANCES, 17 Mar 2023
23. Extended Data Table 1 A summary of the Bronze Age Xinjiang individuals reported in this study от 29 октября 2021 на Wayback Machine. From: Fan Zhang et al. The genomic origins of the Bronze Age Tarim Basin mummies от 30 октября 2021 на Wayback Machine // Nature, 2021
24. Choongwon Jeong et al. A dynamic 6,000-year genetic history of Eurasia's Eastern Steppe от 3 ноября 2020 на Wayback Machine, 2020
25. Tara Ingman et al. Human mobility at Tell Atchana (Alalakh), Hatay, Turkey during the 2nd millennium BC: Integration of isotopic and genomic evidence от 24 мая 2022 на Wayback Machine // Plos One, June 30, 2021
26. Nick Patterson et al. Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age от 1 января 2022 на Wayback Machine // Nature, 22 December 2021
27. Vagheesh M. Narasimhan et al. The formation of human populations in South and Central Asia (англ.) // Science. — 2019-09-06. — Vol. 365, iss. 6457. — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203. — doi:10.1126/science.aat7487. 4 апреля 2021 года. (The Genomic Formation of South and Central Asia, bioRxiv от 17 марта 2021 на Wayback Machine)
28. Margaryan, Derenko et al. Eight Millennia of Matrilineal Genetic Continuity in the South Caucasus от 1 июня 2019 на Wayback Machine, Current Biology 27, 1–6 July 10, 2017, DOI: 10.1016/j.cub.2017.05.087
29. تعیین توالی DNA میتوکندری (mtDNA)بقایای اسکلتی دوره‌ی ایلام میانی محوطه‌ی باستانی هفت‌تپه  (неопр.). Дата обращения: 21 марта 2020. 21 марта 2020 года.
30. Eugenia Boulygina et al. Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the prehistoric Koban culture of the North Caucasus, 2020
31. Xiaoming Zhang et al. A Matrilineal Genetic Perspectiveof Hanging Coffin Customin Southern China and Northern Thailand, April 24, 20
32. Piya Changmai et al. Ancient DNA from Protohistoric Period Cambodia indicates that South Asians admixed with local populations as early as 1st-3rd centuries CE от 14 июля 2022 на Wayback Machine, July 05, 2022
33. Kendra A. Sirak et al. Social stratification without genetic differentiation at the site of Kulubnarti in Christian Period Nubia от 6 марта 2021 на Wayback Machine, February 17, 2021 (Supplementary Figure 5, 6 от 23 октября 2021 на Wayback Machine)
34. Ashot Margaryan et al. Population genomics of the Viking world от 12 февраля 2020 на Wayback Machine, 2019

См. также

Древо гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева

|

(L0)

(L3)

|

(M)

N

|

|

(D)

(E)

(G)

Q

R

(A)

S

(X)

(Y)

(N1)

(N2)

|

|

|

|

C

(Z)

(B)

(F)

(R0)

(P)

(I)

(N1a)

(W)

|

|

|

(HV)

(JT)

U

(K)

|

|

H

(V)

(J)

(T)

Устаревшие кластеры

Ссылки

Общие сведения

• Ian Logan’s
• PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree R
• R YFull MTree 1.02.00 (under construction)

Гаплогруппа R

• • , from National Geographic