Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Поддерживать
www.wikidata.ru-ru.nina.az

PubMed бесплатная поисковая система по биомедицинским исследованиям созданная Национальным центром биотехнологической ин

PubMed

PubMed — бесплатная поисковая система по биомедицинским исследованиям, созданная Национальным центром биотехнологической информации (англ. National Center for Biotechnology Information, NCBI) в 1997 году. Ежедневно портал посещают около 2,5 млн пользователей.

PubMed
image
URL ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Коммерческий Нет
Тип сайта База данных научной периодики
Регистрация По выбору
Язык (-и) Английский
Владелец Национальным центром биотехнологической информации
Начало работы 1997
Текущий статус Функционирует
Страна
image Медиафайлы на Викискладе

PubMed предоставляет доступ сразу к нескольким базам данных, однако ключевой считается коллекция (MEDLINE), содержащая более 30 млн цитирований по естественным, химическим, [англ.], в том числе по биоинженерии и биофизике. Со временем в PubMed были интегрированы базы данных PreMEDLINE, OLDMEDLINE и книжная коллекция NCBI. PubMed также предоставляет доступ к онлайн-репозиторию PubMed Central.

Портал оказал фундаментальное влияние на развитие естественных наук за счёт предоставления исследователям возможности свободно искать нужную им информацию и распространения принципов доказательной медицины и открытой науки.

История создания

image
Джон Биллингс в 1896 году

История PubMed восходит к концу XIX века, когда (полевой хирург) [англ.] вместе с коллегой Робертом Флетчером (проиндексировали) коллекцию Военной медицинской библиотеки. На тот момент она состояла из более чем 50 000 книг, журналов и брошюр по медицине и естественным наукам. Первый из 15 томов каталога был опубликован в 1880 году, последний — в 1895-м. Всего с 1880 по 1961-й было выпущено пять серий каталога-указателя.

Чтобы клиницистам и исследователям было проще искать информацию, с 1879 года при библиотеке начали издавать [англ.] — ежемесячный (библиографический указатель), в котором содержалась информация о последних выпусках журналов по мере их поступления в библиотеку. В 1927 году Index Medicus объединили с аналогичным ежеквартальным изданием (Американской медицинской ассоциации) Quarterly Cumulative Index Medicus. Также в конце каждого года выходил сборный указатель всех ежемесячных выпусков Index Medicus под названием The Cumulated Index Medicus. Так, чтобы в июне 1930 года исследователь мог найти нужную литературу, он должен был сначала просмотреть шесть томов Index Medicus за последние месяцы, а затем тома Cumulated Index Medicus, вышедшие в предыдущие годы.

В 1956 году постановлением Конгресса была основана Национальная библиотека медицины США (англ. United States National Library of Medicine, NLM). Под её началом в 1964 году внедрили механизированные методы индексации библиотечных каталогов. Вскоре была создана библиографическая база данных MEDLARS, заменившая Index Medicus. Однако поиск по MEDLARS по-прежнему представлял собой непростую задачу: специально обученные специалисты должны были переводить каждый поисковой запрос в машинный код, (перфорировать) необходимые карточки, составлять пакеты результатов поиска и вводить их в систему. Затем компьютер проводил автоматический поиск по хранившейся на магнитных лентах базе данных и извлекал соответствующие записи. Впоследствии их можно было распечатать и отправить по почте бандеролью. Среднее время обработки между отправкой запроса и получением результатов составляло 4-6 недель, поэтому любое уточнение поиска требовало дополнительного времени. Несмотря на недостатки, процесс был менее трудоёмким, чем ручной поиск по томам Index Medicus.

В 1971 году Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) при Национальной библиотеке медицины США (NLM) инициировал создание (MEDLINE) — онлайн-версии поисковой системы по биомедицинской литературе. MEDLINE предоставила возможность библиотекам выполнять библиографический поиск в режиме реального времени по проиндексированным в каталогах цитированиям. MEDLINE работала на основе поискового программного обеспечения ELHILL, которое позволяло совершать поиск по названию, автору, заголовкам, датам публикации. Магистральную связь с городами США и Европы обеспечивала коммерческая сеть [англ.]. На момент создания MEDLINE являлась одной из крупнейших машиночитаемых баз данных в мире с более чем 1,5 млн цитирований медицинской литературы.

Изначально доступ к MEDLINE можно было получить только в медицинских библиотеках, работники которых обрабатывали заявки исследователей и преобразовывали запросы, используя предметные заголовки. Затем они выполняли поиск с помощью терминалов, подключённых к компьютеру NLM. Время подключения было слишком дорогим, чтобы тратить его впустую, поэтому пользователи перед отправкой запроса сверялись с печатными томами каталогов, чтобы подготовить наиболее эффективную стратегию поиска. Для улучшения доступности NLM запустила [англ.] — текстовую поисковую систему, основанную на собственном программном обеспечении. Для быстрого поиска информации Entrez использовал систему индексации, позволившую получать доступ к базе данных напрямую. Пользователи могли уточнять условия поиска и распечатывать не более 25 результатов с полными библиографическими данными. Дополнительные цитирования можно было получить по запросу через службу печати, которая впоследствии отправляла их по почте. После двух лет бесплатного предоставления услуг NLM ввела плату за использование MEDLINE. Первоначальная стоимость составляла $6 за час подключения к терминалу и ¢10 за страницу для отдельной печати. В 1976 году ставка была увеличена до $12 за час.

26 июня 1997 года вице-президент США (Альберт Гор) на церемонии в Капитолии объявил о создании PubMed — веб-системы поиска по базе данных естественных наук (MEDLINE). Главной целью проекта стало обеспечение открытого доступа к информации в сфере биомедицины. PubMed расширил Entrez, связав статьи MEDLINE с полнотекстовыми веб-сайтами, поддерживаемыми издателями. На момент открытия PubMed содержала цитирования из более чем 4000 журналов, издаваемых с 1965 года, включая (Cell), (Journal of Biological Chemistry), [англ.], (The New England Journal of Medicine) и (Science).

Со временем PubMed претерпел многочисленные преобразования и стал представлять собой больше, чем интерфейс для поиска по цитированиям MEDLINE. В PubMed были интегрированы базы данных PreMEDLINE, OLDMEDLINE, а также книги из коллекции Национального центра биотехнологической информации. PubMed предоставляет доступ и к базе данных полнотекстовых работ по биомедицине PubMed Central.

Поисковая система PubMed даёт доступ к крупнейшей базе данных цитирований по биомедицине и является важнейшим инструментом для работы специалистов в сфере естественных наук.

Описание

PubMed документирует медицинские и биологические статьи из специальной литературы, а также даёт ссылки на полнотекстовые статьи. PubMed включает в себя данные из следующих областей: медицина, стоматология, (ветеринария), общее здравоохранение, психология, биология, генетика, биохимия, цитология, биотехнология, биомедицина и т. д. Документировано около 3800 биомедицинских изданий. Ежегодно база данных PubMed увеличивается на 500 000 документов. Поиск происходит по принципу Medical Subject Headings (MeSH).

Каждой статье присваивается уникальный идентификационный номер PMID (англ. PubMed Identifier — идентификатор PubMed).

Коллекция

image
Схематичное изображение коллекции PubMed

MEDLINE

MEDLINE является ключевой базой данных PubMed. Она содержит актуальную информацию для специалистов в сфере фундаментальных исследований, медицинской помощи, (социальной гигиены и организации здравоохранения). В MEDLINE включены данные о работах по естественным, химическим, [англ.], а также по биоинженерии и биофизике. Все включённые в MEDLINE журналы и статьи проходят тщательную проверку на предмет качества используемой литературы, содержания, объёма, доступности статей на иностранных языках, рецензирования. Издатели отправляют электронные метаданные напрямую в NLM, после чего сотрудники библиотеки вручную индексируют поступающие элементы — проверяют ошибки и присваивают Medical Subject Headings (MeSH).

MEDLINE содержит информацию только о метаданных, однако в процессе индексации к работам в открытом доступе добавляют ссылки на полную версию. Большинство материалов поступает из англоязычных источников или имеет абстракты на английском языке. На июнь 2022 года портал MEDLINE содержала более 30 млн цитирований биомедицинской литературы.

PreMEDLINE

В PubMed интегрирована PreMEDLINE — база данных цитирований научных работ, которые уже были отправлены в MEDLINE, но ещё не были индексированы. После обработки они автоматически загружаются в MEDLINE и удаляются из PreMEDLINE. База данных чаще всего используется для поиска справочных материалов по «актуальным темам». Библиографические описания из базы данных PreMEDLINE имеют специальную пометку [PubMed — in process].

OLDMEDLINE

В 2003 году в PubMed была интегрирована база данных OLDMEDLINE. Она содержит цитирования статей, опубликованных в международных биомедицинских журналах в сфере медицины, доклинических исследований и смежных наук о здоровье, которые были опубликованы в печатных указателях 1953—1965 годов. [англ.] (DMDI) совместно с Международным центром MEDLARS в Германии и Национальной библиотекой медицины США составили OLDMEDLINE в середине 1990-х. DMDI владела магнитными лентами с исходными данными Cumulated Index Medicus (CIM) за 1953—1965 годы, которые впоследствии были преобразованы и переданы в NLM. Цитирования OLDMEDLINE были созданы с использованием стандартов, отличных от MEDLINE. Также в цитированиях OLDMEDLINE отсутствуют накопленные изменения и улучшения, которые были внесены в другие файлы NLM во время ежегодного обслуживания. Некоторые разделы могут содержать устаревшие или ошибочные данные. База данных в основном отражает содержание оригинальных печатных указателей, которые были созданы в соответствии с политикой и процедурами того времени.

Книжная полка NCBI

Книжная полка Национального центра биотехнологической информации (NCBI) — это бесплатный онлайн-архив, содержащий более 6000 книг и документов по естественным наукам и здравоохранению. Он берёт начало в 1999 году с коллекции дисциплинарных учебников и ключевых текстов по этим отраслям. Впоследствии она была дополнена собранием тематических монографий в открытом доступе. Авторы, редакторы, спонсоры и издатели самостоятельно предоставляют полнотекстовое содержание работ в формате XML. Это даёт им ряд преимуществ, главным из которых является расширение круга потенциальных читателей.

PubMed Central

Основная статья: PubMed Central

PubMed не предоставляет доступ к полнотекстовым версиям работ, однако содержит ссылки на PubMed Central (PMC) — бесплатный онлайн-репозиторий научных исследований. PMC был основан в 1999 году по инициативе директора (Национальных институтов здравоохранения) (NIH) (Гарольда Вармуса) и запущен в 2000-м. До создания PubMed Central исследователи были вынуждены самостоятельно искать полные версии работ на сайтах издательств. При этом большинство из таких публикаций были скрыты за пейволлом. C появлением онлайн-репозитория пользователи могут напрямую получить полнотекстовые версии работ (если они выложены в открытом доступе), перейдя по ссылке из PubMed.

В 2008 году Национальные институты здравоохранения объявили о внедрении политики открытого доступа. Одним из её положений стало обязательное размещение в PubMed Central копий работ, опубликованных на гранты NIH. На 2019-й год, коллекция PMC примерно на 88 % состояла из статей журналов, входящих в базы данных PubMed, и на 12 % из отдельных статей, попавших под мандат NIH. На июнь 2022 года в PMC было архивировано более 8 млн работ.

Отдельные исследователи критикуют интеграцию PubMed и PubMed Central за наличие в последнем публикаций из (хищнических журналов). Так, исследование 2017 года показало, что более 10 % хищнических журналов по некоторым смежным дисциплинам проиндексированы в PubMed. К апрелю 2017 года эти показатели увеличились до 23,7 % для работ в сфере реабилитации, 16 % для нейронаук и 24,7 % для неврологии.

Другие

Также в PubMed интегрированы цитирования из таких уникальных баз данных, как HealthSTAR, AIDSLINE, HISTLINE, SPACELINE, BIOETHICSLINE.

Поиск

image
Пример поискового запроса в PubMed

Принцип работы

Домашняя страница PubMed содержит простое окно поиска и гиперссылки на руководства, инструменты и другие ресурсы. После того как пользователь вводит вопрос, PubMed автоматически уточняет его через систему идентификации MeSH (Medical Subject Headings). Это позволяет проводить наиболее тщательный поиск по всем материалам в связанных базах данных.

Затем PubMed отображает полученные результаты. По умолчанию система сортирует результаты по дате добавления в PubMed и представляет их в сводном формате с 20 работами на каждой странице. Пользователям доступны название статьи, список авторов, источник информации (например, название журнала, за которым следует дата публикации, том, выпуск, страницы) и уникальный номер записи PubMed или идентификатор PubMed (PMID). Для статей на языке, отличном от английского, заголовок переводится на английский язык и помещается в скобки. В этом случае язык оригинала указывается в качестве дополнительной записи. Название журнала для каждой записи отображается в сокращённом виде.

Страница результатов также предоставляет пользователю инструменты и параметры для фильтрации по типу и дате публикации. Если количество выданных статей достаточно велико, в правом верхнем углу страницы отображается (гистограмма), иллюстрирующая тенденцию их использования за последние годы. Все данные можно загрузить в формате (CSV). PubMed также отображает абстракт статьи, контакты основного автора, ссылку на полный текст и на связанные цитирования.

PubMed не хранит полные версии самих статей. Однако если полная версия работы доступна на сайте издательства, то система автоматически генерирует на неё ссылку, даже если статья скрыта за пейволлом. Если полнотекстовая версия размещена в репозитории PubMed Central, ссылка на полный текст появится при отображении её аннотации в PubMed.

Индексирование

Основная статья: Medical Subject Headings

Для индексирования статей в PubMed интегрирована система Medical Subject Headings (рус. Медицинские предметные заголовки). MeSH позволяет создать стандартную словарную систему, способствующую эффективному поиску информации. Примером могут послужить слова «(телемедицина)» и «телездравоохранение», которые часто используют как взаимозаменяемые. База данных MeSH содержит контролируемый словарь и индексные термины. Доступ к ней можно получить с домашней страницы PubMed. В MeSH есть три основных понятия: предметные заголовки (дескрипторы), условия ввода и подзаголовки (квалификаторы). MeSH позволяет бороться с проблемой непоследовательной терминологии в биомедицинских работах, которая оказывает большое влияние на точность запросов.

Сотрудники NLM вручную идентифицируют термины MeSH (обычно 10-12) в каждой поступающей работе. Это позволяет предопределять термины и интегрировать синонимы. Например, запрос «сердечный приступ» проиндексирован в MeSH как «инфаркт миокарда».

После того как пользователь вводит запрос, PubMed автоматически включает альтернативные варианты написания и термины MeSH, связанные с запрошенным словосочетанием. Использование MeSH для поиска позволяет сделать его более точным. Термины расположены иерархически по предметным категориям. Для расширения или сужения поиска, пользователи могут самостоятельно выбрать расположенные выше или ниже в структуре термины.

MeSH также позволяет сосредоточить поиск на конкретных вопросах рассматриваемой темы, например, экономические аспектах телемедицины при диабете. Для этого пользователям необходимо сначала выполнить поиск по слову «телемедицина», но перед отправкой термина MeSH в конструктор выбрать подзаголовок (квалификатор), отметив соответствующие флажки. Это приведет к появлению комбинации термина MeSH и подзаголовка в окне построителя поиска, в данном случае: «Телемедицина/экономика»[Mesh]. Подзаголовки MeSH присоединяются к предметному заголовку с помощью косой черты (/). Поисковый запрос останется в окне построителя поиска, что позволяет пользователям добавлять к запросу другие термины. Затем поисковый запрос может быть дополнен термином MeSH для диабета, то есть «Сахарный диабет» [Mesh], и комбинация этих двух терминов может быть отправлена для поиска в PubMed. Этот метод значительно сократит количество результатов по сравнению с использованием термина MeSH без квалификатора. Однако результаты будут более конкретными и, следовательно, более соответствующими запросу.

Интерфейс

Интерфейс портала несколько раз подвергался масштабным изменениям. В 2000 году его дизайн был полностью изменён, были добавлены фильтры по языку и годам, а также функция просмотра истории поиска, сохранения, анализа и распечатки выбранных цитирований по одному или нескольким результатам поиска.

В начале 2020 года была запущена обновлённая версия, получившая неоднозначные отзывы от пользователей, привыкших к старому интерфейсу. Три основные функции «Использование PubMed», «Инструменты PubMed» и «Дополнительные ресурсы» были изменены на «Обучение», «Найти», «Скачать» и «Исследовать». Новая версия делает упор на ускоренный поиск информации и более удобна в мобильной версии. Также была добавлена функция «Результаты по годам», что позволяет пользователю отслеживать тенденции использования. Тип статьи, наличие текста, возраст и язык фильтры являются одними из популярных инструментов, перенесённых из старой версии PubMed.

Инструменты

askMEDLINE

askMEDLINE — бесплатный текстовый инструмент поиска для MEDLINE/PubMed. Он был создан на основе PICO (англ. Patient, Intervention, Comparison, Outcome или «Пациент, Вмешательство, Сравнение, Результат») — метода поиска по MEDLINE/PubMed, разработанного для занятых клиницистов, заинтересованных в практике доказательной медицины, но не знакомых с контролируемыми словарями, которые могли бы сделать поиск более эффективным. Пользователи askMEDLINE могут ввести клинический вопрос «разговорным» языком, а поисковая система самостоятельно найдёт соответствующие журнальные статьи.

В основе askMEDLINE лежит многоэтапная стратегия поиска. На первой стадии (синтаксический анализатор) игнорирует знаки препинания и удаляет слова, найденные в списке «стоп-слов». Затем синтаксический анализатор, PHP-скрипт, отправляет изменённый запрос в E-Utilities PubMed Entrez. Файл Extensible Markup Language (XML), возвращаемый E-Utilities, указывает категорию каждого термина в запросе. Термины, помеченные как «Все поля», означают, что они не являются ни терминами медицинских предметных рубрик (MeSH), ни подзаголовками MeSH. Если слово «Все поля» находится в резервном словаре, оно остается в запросе; если это не так, он удаляется. Остальные термины отправляются обратно в PubMed через E-Utilities. Если число извлечений журнала после первого раунда составляет от 1 до 50 000, первые 20 результатов отображаются и поиск прекращается.

Поиск может перейти ко второму кругу, если в первом раунде было использовано слишком много фильтров, в результате чего достаточное количество работ не было найдено, или если число поисковых запросов в первом раунде превысило 50 000 статей (указание на то, что поиск был слишком широким).

Только за первый год работы askMEDLINE было получено более 15 000 запросов, в основном в виде вопросов или сложных фраз. Самыми запрашиваемыми были вопросы по терапии.

My NCBI

С 2010 года пользователи PubMed могли создавать собственные учётные записи благодаря функции My NCBI. Персонализированный подход позволял сохранять релевантные цитирования и поисковые запросы, задавать уникальные параметры поиска и настраивать поисковые оповещения, а также использовать другие дополнительные параметры в PubMed. С 1 июня 2021 года учётные записи NCBI перестали быть доступны. Пользователям было предложено входить в систему через регистрацию на eRA Commons, (ORCID), Google, [англ.] или с помощью учётных данных Einstein AD.

LinkOut

LinkOut «связывает» PubMed с любыми внешними по отношению к NCBI ресурсами. Программа предоставляет пользователям доступ к полнотекстовым версиям статей, расположенных на издательских порталах. На июнь 2022 года, 4271 издательства предоставляли LinkOut данные на регулярной основе.

PubCrawler

PubMed интегрирован с веб-сервисом PubCrawler, позволяющим пользователям создавать персонализированные веб-страницы. Изначально PubCrawler существовал как (Perl)-скрипт, автоматически отслеживающий новые результаты для предопределённых запросов в PubMed через поисковую систему Entrez NCBI. Однако вскоре его создатели решили сделать его открытым для других пользователей. После регистрации пользователи могут настроить свои запросы для PubMed через конфигуратор PubCrawler. После получения результатов, система автоматически сравнивает их с предыдущими запросами пользователя, оставив только непросмотренные работы. Таким образом сервис позволяет отслеживать новые статьи и рекомендации. PubCrawler также действует как система автоматического оповещения, отправляя короткие уведомления или электронные письма с последними обновлениями по мере их доступности.

PubMed Commons

В 2013 году NCBI запустил пилотную версию PubMed Commons. Сервис позволял пользователям публично комментировать размещённые в базе данных абстракты. Создатели стремились создать пространство для дискуссии о научных работах и таким образом бороться с проблемой (невоспроизводимости) научного знания, однако услуга не вызвала ажиотажа среди исследователей. Несмотря на это, в 2015 году создатели проекта продлили финансирование PubMed Commons ещё на год. Однако за этот период комментарии были оставлены только к 6000 из 28 млн статей и в 2018 году было принято окончательное решение о прекращении работы сервиса. Пользователям было рекомендовано переходить на аналогичную платформу PubPeer, которая позволяла комментаторам оставаться анонимными.

PubMed Identifier

PubMed Identifier или PMID представляет собой инвентарный номер от 1 до 8 цифр для управления записями в PubMed. Идентификатор присваивают каждой индексируемой в базе данных работе, за счёт чего любое цитирование можно найти с помощью PMID. С увеличением коллекции, в 2012 году было принято решение расширить идентификатор PMID и добавить десятитысячную дробь (например, PMID-10097079.2). До 2004 года многие записи содержали уникальный идентификатор MEDLINE в дополнение к PMID, однако впоследствии от него решили отказаться.

PubMed Mobile

В 2012 году вышло приложение PubMed для iOS.

В 2015 году для пользователей, проверяющих сайт с мобильных устройств, стала доступна мобильная версия — PubMed Mobile. Обновление 2020 года улучшило работу PubMed Mobile на устройствах с портретным соотношением сторон изображения.

Влияние

PubMed является одним из важнейших инструментов поиска биомедицинской литературы, его сравнивают с поисковой системой Google для естественных наук. Платформа предоставляет пользователям бесплатный доступ к базе данных цитирований миллионов научных публикаций практически по всем англоязычным биомедицинским исследованиям. По данным 2017 года, портал ежедневно посещали около 2,5 млн пользователей.

Чаще всего PubMed используют исследователи и специалисты в сфере биомедицины и естественных наук. Однако представители широкой общественности могут легко найти информацию о передовых исследованиях по любой болезни. Все проиндексированные в MEDLINE работы соответствуют строгим критериям, поэтому издатели, библиотекари и авторы используют ресурс для верификации качества своих источников.

PubMed способствует распространению принципов открытой науки и свободного доступа к научному знанию. Портал связан с PubMed Central — первым онлайн-репозиторием исследовательской литературы. В 2005 году NIH внедрила политику обязательного предоставления рецензируемых первичных копий в центральную базу данных PubMed. Таким образом, все профинансированные государством исследования становятся доступными для общественности. Это помогает практикующим специалистам получать доступ к важнейшим материалам в их области и бороться с пейволлами. Открытый доступ также повышает вероятность цитирования работы автора.

Базы данных PubMed часто используют и для анализа наукометрии. Так, коммерческая фирма Verum Analytics из Коннектикута разработала инструмент анализа и улучшения воспроизводимости работ, основанный на измерении данных о статьях, в которых они цитируются.

Примечания

  1. Fiorini N., Lipman D., Lu Z. [10.7554/eLife.28801 Towards PubMed 2.0] // eLife. — 2017.
  2. Michael Price. They redesigned PubMed, a beloved website. It hasn't gone over well. Science (22 мая 2020). Дата обращения: 19 июня 2022. 21 мая 2022 года.
  3. PubMed. PubMed. Дата обращения: 28 июня 2022. 30 июня 2022 года.
  4. Williamson, 2019.
  5. Benson, 1997.
  6. Lindberg, 2000.
  7. Hunter, 2006, pp. 589—594.
  8. Gray, 2013.
  9. Cross, 2007.
  10. Canese, 2013.
  11. J. Ostell. Entrez: The NCBI Search and Discovery Engine // International Conference on Data Integration in the Life Sciences. — 2012.
  12. Kent Anderson. A Confusion of Journals — What Is PubMed Now? The Scholarly Kitchen (7 сентября 2017). Дата обращения: 22 июня 2022. 24 марта 2022 года.
  13. Hewitt, A., Mackey, D. Keep PubMed running at all costs. // Nature. — 2013.
  14. PubMed Help. PMID [PMID]. National Center for Biotechnology Information. Дата обращения: 23 июля 2013. 11 июля 2013 года.
  15. PubMed. PubMed. Дата обращения: 26 июня 2022. 6 января 2022 года.
  16. Fitzpatrick, 2008.
  17. OLDMEDLINE Citations Join PubMed®. NLM. Дата обращения: 24 июня 2022. 15 апреля 2022 года.
  18. Lathrop, 2018.
  19. Groote, 2000.
  20. Eliot Marshall. [DOI: 10.1126/science.286.5440.655a PNAS to Join PubMed Central--On Condition] // Science. — 1999.
  21. Wadman, M. PubMed Central offers deal on content. // Nature. — 2001.
  22. Sequeira, E., McEntyre, J. & Lipman, D. PubMed Central decentralized // Nature. — 2001.
  23. Roberts, 2001, pp. 381—382.
  24. About PMC. PubMed Central. Дата обращения: 27 июня 2022. 13 августа 2011 года.
  25. Manca, 2017.
  26. Liz Pope. PubMed Central // The Serials Librarian. — 2001.
  27. Vanteru, B.C., Shaik, J.S. & Yeasin, M. Semantically linking and browsing PubMed abstracts with gene ontology. // BMC Genomics. — 2008. — Т. 10, вып. 9. 30 июня 2022 года.
  28. Fatehi, 2014.
  29. Constantino Carlos Reyes-Aldasoro. The proportion of cancer-related entries in PubMed has increased considerably; is cancer truly “The Emperor of All Maladies”? // Plos One. — 2017. — Т. 12, вып. 3. 30 июня 2022 года.
  30. Mette Søgaard, P.Andersen, Henrik C.Schønheyder. Searching PubMed for studies on bacteremia, bloodstream infection, septicemia, or whatever the best term is: A note of caution // American Journal of Infection Control. — 2012. — Т. 40, вып. 3.
  31. Chapman, 2009.
  32. PubMed: The Basics: Medical Subject Headings (MeSH). Marshall Ketchum University. Дата обращения: 24 июня 2022.
  33. White, 2020.
  34. Fontelo, 2005.
  35. Fontelo, P., Liu, F., Ackerman, M., Schardt, C. M., & Keitz, S. A. askMEDLINE: a report on a year-long experience // Annual Symposium proceedings. — 2006. 30 июня 2022 года.
  36. Searching PubMed: My NCBI Accounts. University Libraries. Дата обращения: 24 июня 2022. 16 апреля 2021 года.
  37. PubMed Tips: PubMed (My NCBI) (недоступная ссылка — история). Einstein. Дата обращения: 24 июня 2022.
  38. LinkOut Providers. NCBI. Дата обращения: 28 июня 2022. 14 октября 2017 года.
  39. Kwan, 2003.
  40. Hokamp, K., & Wolfe, K. H. PubCrawler: keeping up comfortably with PubMed and GenBank // Nucleic acids research. — 2004.
  41. Reardon, S. PubMed opens for comment. // Nature. — 2013.
  42. Collins, F., Tabak, L. Policy: NIH plans to enhance reproducibility // Nature. — 2014.
  43. PubMed shuts down its comments feature, PubMed Commons. Retraction Watch. Дата обращения: 19 июня 2022. 28 июня 2022 года.
  44. Elie Dolgin. PubMed Commons closes its doors to comments. Nature (2 февраля 2018). Дата обращения: 20 июня 2022. 17 июня 2022 года.
  45. PubMed Unique Identifier (PMID). National Library of Medicine. Дата обращения: 24 июня 2022. 27 апреля 2019 года.
  46. Neil Versel. PubMed mobile app far more popular than web. Mobi Health News (21 ноября 2013). Дата обращения: 22 июня 2022. 11 июля 2015 года.
  47. Megan von Isenburg. iMedical Apps (6 февраля 2015). Дата обращения: 22 июня 2022. 13 июня 2021 года.
  48. Finding a Paper on PubMed Does Not Mean the Paper Is Any Good. McGill. Дата обращения: 28 июня 2022. 2 июня 2022 года.
  49. David Beebe. Public Access Success at PubMed // Science. — 2006. 30 июня 2022 года.
  50. Lu, 2010.
  51. Michael Stebbinserica Davislucas Roylandand Gartrell White. [DOI: 10.1126/science.313.5783.43b Public Access Failure at PubMed] // Science. — 2006.
  52. Dalmeet Singh Chawla. Online tool calculates reproducibility scores of PubMed papers. Science (22 января 2018). Дата обращения: 20 июня 2022. 6 ноября 2021 года.

Литература

  • Cross J. MEDLINE, PubMed, PubMed Central, and the NLM (англ.) // Editor's Bulletin. — 2007. — Vol. 2, iss. 1. — doi:10.1080/17521740701702115.
  • Fatehi F., Gray L.C., Wootton R. How to improve your PubMed/MEDLINE searches: 3. advanced searching, MeSH and My NCBI. (англ.) // Journal of Telemedicine and Telecare. — 2014. — Vol. 20, no. 2. — P. 102—112. — doi:10.1177/1357633X13519036.
  • Fatehi F., Gray L.C., Wootton R. How to improve your PubMed/MEDLINE searches: 1. background and basic searching. (англ.) // Journal of Telemedicine and Telecare. — 2013. — Vol. 19, no. 8. — P. 479—486. — doi:10.1177/1357633X13512061.
  • Fitzpatrick R. MEDLINE, Old and New (англ.) // Medical Reference Services Quarterly. — 2008. — Vol. 17, no. 1. — P. 49—60. — doi:10.1300/J115V17N01_05.
  • Fontelo P., Liu F., Ackerman M. askMEDLINE: a free-text, natural language query tool for MEDLINE/PubMed. (англ.) // BMC Med Inform Decis Mak.. — 2005. — Vol. 5, no. 5. — P. 479—486. — doi:10.1186/1472-6947-5-5.
  • Benson D., Rapp B. Vice President Launches PubMed, Lauds Free MEDLINE Access (англ.) // NCBI News. — 1997. — P. 1—8.
  • Canese, K., Weis S. PubMed: the bibliographic database. (англ.) // The NCBI handbook. — 2013. — Iss. 1.
  • Chapman D. Advanced Search Features of PubMed (англ.) // Journal of the Canadian Academy of Child and Adolescent Psychiatry. — 2009. — Vol. 18, no. 1. — P. 58—59. — doi:10.1177/1357633X13519036.
  • Sandy L. De Groote. PubMed, Internet Grateful Med, and Ovid (англ.) // Medical Reference Services Quarterly. — 2000. — Iss. 4. — P. 1-13.
  • Hunter L., Bretonnel K. Biomedical Language Processing: Perspective What’s Beyond PubMed? (англ.) // Molecular Cell. — 2006. — Vol. 21, no. 1. — P. 589—594. — doi:10.1016/j.molcel.2006.02.012.
  • Kwan K. Chapter 17: LinkOut: Linking to External Resources from Entrez Databases (англ.) // GenBank: The Nucleotide Sequence Database. — 2003.
  • Lathrop S., Latterner M. What it takes to get into Bookshelf (англ.) // Journal Article Tag Suite Conference (JATS-Con) Proceedings 2018. — 2018.
  • Lindberg D. Internet Access to the National Library of Medicinen (англ.) // National library of mediicne. — 2000. — Vol. 4. — P. 7256—260.
  • Manca A., Cugusi L., Dvir Z., Deriu Z. PubMed should raise the bar for journal inclusion (англ.) // Molecular Cell. — 2017. — Vol. 390, no. 1. — P. 734—735.
  • Ossom P. W. Exploring PubMed as a reliable resource for scholarly communications services (англ.) // J Med Libr Assoc. — 2019. — Vol. 107, no. 1. — P. 16—29. — doi:10.5195/jmla.2019.433.
  • Richard J. R. PubMed Central: The GenBank of the published literature (англ.) // PNAS. — 2001. — Vol. 98, no. 1. — P. 381—382.
  • White J. PubMed 2.0 (англ.) // Medical Reference Services Quarterly. — 2020. — Vol. 39, no. 4. — P. 382—387. — doi:10.1080/02763869.2020.1826228.
  • Zhiyong L. PubMed and beyond: a survey of web tools for searching biomedical literature (англ.) // Database. — 2010. — P. 1—13. — doi:10.1093/database/baq036.

Ссылки

  • pubmed.gov — Официальный сайт PubMed

Википедия, чтение, книга, библиотека, поиск, нажмите, истории, книги, статьи, wikipedia, учить, информация, история, скачать, скачать бесплатно, mp3, видео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, картинка, музыка, песня, фильм, игра, игры, мобильный, телефон, Android, iOS, apple, мобильный телефон, Samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Сеть, компьютер

Дата публикации:
PubMed besplatnaya poiskovaya sistema po biomedicinskim issledovaniyam sozdannaya Nacionalnym centrom biotehnologicheskoj informacii angl National Center for Biotechnology Information NCBI v 1997 godu Ezhednevno portal poseshayut okolo 2 5 mln polzovatelej PubMedURL ncbi nlm nih gov pubmed Kommercheskij NetTip sajta Baza dannyh nauchnoj periodikiRegistraciya Po vyboruYazyk i AnglijskijVladelec Nacionalnym centrom biotehnologicheskoj informaciiNachalo raboty 1997Tekushij status FunkcioniruetStrana SShA Mediafajly na Vikisklade PubMed predostavlyaet dostup srazu k neskolkim bazam dannyh odnako klyuchevoj schitaetsya kollekciya MEDLINE soderzhashaya bolee 30 mln citirovanij po estestvennym himicheskim angl v tom chisle po bioinzhenerii i biofizike So vremenem v PubMed byli integrirovany bazy dannyh PreMEDLINE OLDMEDLINE i knizhnaya kollekciya NCBI PubMed takzhe predostavlyaet dostup k onlajn repozitoriyu PubMed Central Portal okazal fundamentalnoe vliyanie na razvitie estestvennyh nauk za schyot predostavleniya issledovatelyam vozmozhnosti svobodno iskat nuzhnuyu im informaciyu i rasprostraneniya principov dokazatelnoj mediciny i otkrytoj nauki Istoriya sozdaniyaDzhon Billings v 1896 godu Istoriya PubMed voshodit k koncu XIX veka kogda polevoj hirurg angl vmeste s kollegoj Robertom Fletcherom proindeksirovali kollekciyu Voennoj medicinskoj biblioteki Na tot moment ona sostoyala iz bolee chem 50 000 knig zhurnalov i broshyur po medicine i estestvennym naukam Pervyj iz 15 tomov kataloga byl opublikovan v 1880 godu poslednij v 1895 m Vsego s 1880 po 1961 j bylo vypusheno pyat serij kataloga ukazatelya Chtoby klinicistam i issledovatelyam bylo proshe iskat informaciyu s 1879 goda pri biblioteke nachali izdavat angl ezhemesyachnyj bibliograficheskij ukazatel v kotorom soderzhalas informaciya o poslednih vypuskah zhurnalov po mere ih postupleniya v biblioteku V 1927 godu Index Medicus obedinili s analogichnym ezhekvartalnym izdaniem Amerikanskoj medicinskoj associacii Quarterly Cumulative Index Medicus Takzhe v konce kazhdogo goda vyhodil sbornyj ukazatel vseh ezhemesyachnyh vypuskov Index Medicus pod nazvaniem The Cumulated Index Medicus Tak chtoby v iyune 1930 goda issledovatel mog najti nuzhnuyu literaturu on dolzhen byl snachala prosmotret shest tomov Index Medicus za poslednie mesyacy a zatem toma Cumulated Index Medicus vyshedshie v predydushie gody V 1956 godu postanovleniem Kongressa byla osnovana Nacionalnaya biblioteka mediciny SShA angl United States National Library of Medicine NLM Pod eyo nachalom v 1964 godu vnedrili mehanizirovannye metody indeksacii bibliotechnyh katalogov Vskore byla sozdana bibliograficheskaya baza dannyh MEDLARS zamenivshaya Index Medicus Odnako poisk po MEDLARS po prezhnemu predstavlyal soboj neprostuyu zadachu specialno obuchennye specialisty dolzhny byli perevodit kazhdyj poiskovoj zapros v mashinnyj kod perforirovat neobhodimye kartochki sostavlyat pakety rezultatov poiska i vvodit ih v sistemu Zatem kompyuter provodil avtomaticheskij poisk po hranivshejsya na magnitnyh lentah baze dannyh i izvlekal sootvetstvuyushie zapisi Vposledstvii ih mozhno bylo raspechatat i otpravit po pochte banderolyu Srednee vremya obrabotki mezhdu otpravkoj zaprosa i polucheniem rezultatov sostavlyalo 4 6 nedel poetomu lyuboe utochnenie poiska trebovalo dopolnitelnogo vremeni Nesmotrya na nedostatki process byl menee trudoyomkim chem ruchnoj poisk po tomam Index Medicus V 1971 godu Nacionalnyj centr biotehnologicheskoj informacii NCBI pri Nacionalnoj biblioteke mediciny SShA NLM iniciiroval sozdanie MEDLINE onlajn versii poiskovoj sistemy po biomedicinskoj literature MEDLINE predostavila vozmozhnost bibliotekam vypolnyat bibliograficheskij poisk v rezhime realnogo vremeni po proindeksirovannym v katalogah citirovaniyam MEDLINE rabotala na osnove poiskovogo programmnogo obespecheniya ELHILL kotoroe pozvolyalo sovershat poisk po nazvaniyu avtoru zagolovkam datam publikacii Magistralnuyu svyaz s gorodami SShA i Evropy obespechivala kommercheskaya set angl Na moment sozdaniya MEDLINE yavlyalas odnoj iz krupnejshih mashinochitaemyh baz dannyh v mire s bolee chem 1 5 mln citirovanij medicinskoj literatury Iznachalno dostup k MEDLINE mozhno bylo poluchit tolko v medicinskih bibliotekah rabotniki kotoryh obrabatyvali zayavki issledovatelej i preobrazovyvali zaprosy ispolzuya predmetnye zagolovki Zatem oni vypolnyali poisk s pomoshyu terminalov podklyuchyonnyh k kompyuteru NLM Vremya podklyucheniya bylo slishkom dorogim chtoby tratit ego vpustuyu poetomu polzovateli pered otpravkoj zaprosa sveryalis s pechatnymi tomami katalogov chtoby podgotovit naibolee effektivnuyu strategiyu poiska Dlya uluchsheniya dostupnosti NLM zapustila angl tekstovuyu poiskovuyu sistemu osnovannuyu na sobstvennom programmnom obespechenii Dlya bystrogo poiska informacii Entrez ispolzoval sistemu indeksacii pozvolivshuyu poluchat dostup k baze dannyh napryamuyu Polzovateli mogli utochnyat usloviya poiska i raspechatyvat ne bolee 25 rezultatov s polnymi bibliograficheskimi dannymi Dopolnitelnye citirovaniya mozhno bylo poluchit po zaprosu cherez sluzhbu pechati kotoraya vposledstvii otpravlyala ih po pochte Posle dvuh let besplatnogo predostavleniya uslug NLM vvela platu za ispolzovanie MEDLINE Pervonachalnaya stoimost sostavlyala 6 za chas podklyucheniya k terminalu i 10 za stranicu dlya otdelnoj pechati V 1976 godu stavka byla uvelichena do 12 za chas 26 iyunya 1997 goda vice prezident SShA Albert Gor na ceremonii v Kapitolii obyavil o sozdanii PubMed veb sistemy poiska po baze dannyh estestvennyh nauk MEDLINE Glavnoj celyu proekta stalo obespechenie otkrytogo dostupa k informacii v sfere biomediciny PubMed rasshiril Entrez svyazav stati MEDLINE s polnotekstovymi veb sajtami podderzhivaemymi izdatelyami Na moment otkrytiya PubMed soderzhala citirovaniya iz bolee chem 4000 zhurnalov izdavaemyh s 1965 goda vklyuchaya Cell Journal of Biological Chemistry angl The New England Journal of Medicine i Science So vremenem PubMed preterpel mnogochislennye preobrazovaniya i stal predstavlyat soboj bolshe chem interfejs dlya poiska po citirovaniyam MEDLINE V PubMed byli integrirovany bazy dannyh PreMEDLINE OLDMEDLINE a takzhe knigi iz kollekcii Nacionalnogo centra biotehnologicheskoj informacii PubMed predostavlyaet dostup i k baze dannyh polnotekstovyh rabot po biomedicine PubMed Central Poiskovaya sistema PubMed dayot dostup k krupnejshej baze dannyh citirovanij po biomedicine i yavlyaetsya vazhnejshim instrumentom dlya raboty specialistov v sfere estestvennyh nauk OpisaniePubMed dokumentiruet medicinskie i biologicheskie stati iz specialnoj literatury a takzhe dayot ssylki na polnotekstovye stati PubMed vklyuchaet v sebya dannye iz sleduyushih oblastej medicina stomatologiya veterinariya obshee zdravoohranenie psihologiya biologiya genetika biohimiya citologiya biotehnologiya biomedicina i t d Dokumentirovano okolo 3800 biomedicinskih izdanij Ezhegodno baza dannyh PubMed uvelichivaetsya na 500 000 dokumentov Poisk proishodit po principu Medical Subject Headings MeSH Kazhdoj state prisvaivaetsya unikalnyj identifikacionnyj nomer PMID angl PubMed Identifier identifikator PubMed KollekciyaShematichnoe izobrazhenie kollekcii PubMedMEDLINE MEDLINE yavlyaetsya klyuchevoj bazoj dannyh PubMed Ona soderzhit aktualnuyu informaciyu dlya specialistov v sfere fundamentalnyh issledovanij medicinskoj pomoshi socialnoj gigieny i organizacii zdravoohraneniya V MEDLINE vklyucheny dannye o rabotah po estestvennym himicheskim angl a takzhe po bioinzhenerii i biofizike Vse vklyuchyonnye v MEDLINE zhurnaly i stati prohodyat tshatelnuyu proverku na predmet kachestva ispolzuemoj literatury soderzhaniya obyoma dostupnosti statej na inostrannyh yazykah recenzirovaniya Izdateli otpravlyayut elektronnye metadannye napryamuyu v NLM posle chego sotrudniki biblioteki vruchnuyu indeksiruyut postupayushie elementy proveryayut oshibki i prisvaivayut Medical Subject Headings MeSH MEDLINE soderzhit informaciyu tolko o metadannyh odnako v processe indeksacii k rabotam v otkrytom dostupe dobavlyayut ssylki na polnuyu versiyu Bolshinstvo materialov postupaet iz angloyazychnyh istochnikov ili imeet abstrakty na anglijskom yazyke Na iyun 2022 goda portal MEDLINE soderzhala bolee 30 mln citirovanij biomedicinskoj literatury PreMEDLINE V PubMed integrirovana PreMEDLINE baza dannyh citirovanij nauchnyh rabot kotorye uzhe byli otpravleny v MEDLINE no eshyo ne byli indeksirovany Posle obrabotki oni avtomaticheski zagruzhayutsya v MEDLINE i udalyayutsya iz PreMEDLINE Baza dannyh chashe vsego ispolzuetsya dlya poiska spravochnyh materialov po aktualnym temam Bibliograficheskie opisaniya iz bazy dannyh PreMEDLINE imeyut specialnuyu pometku PubMed in process OLDMEDLINE V 2003 godu v PubMed byla integrirovana baza dannyh OLDMEDLINE Ona soderzhit citirovaniya statej opublikovannyh v mezhdunarodnyh biomedicinskih zhurnalah v sfere mediciny doklinicheskih issledovanij i smezhnyh nauk o zdorove kotorye byli opublikovany v pechatnyh ukazatelyah 1953 1965 godov angl DMDI sovmestno s Mezhdunarodnym centrom MEDLARS v Germanii i Nacionalnoj bibliotekoj mediciny SShA sostavili OLDMEDLINE v seredine 1990 h DMDI vladela magnitnymi lentami s ishodnymi dannymi Cumulated Index Medicus CIM za 1953 1965 gody kotorye vposledstvii byli preobrazovany i peredany v NLM Citirovaniya OLDMEDLINE byli sozdany s ispolzovaniem standartov otlichnyh ot MEDLINE Takzhe v citirovaniyah OLDMEDLINE otsutstvuyut nakoplennye izmeneniya i uluchsheniya kotorye byli vneseny v drugie fajly NLM vo vremya ezhegodnogo obsluzhivaniya Nekotorye razdely mogut soderzhat ustarevshie ili oshibochnye dannye Baza dannyh v osnovnom otrazhaet soderzhanie originalnyh pechatnyh ukazatelej kotorye byli sozdany v sootvetstvii s politikoj i procedurami togo vremeni Knizhnaya polka NCBI Knizhnaya polka Nacionalnogo centra biotehnologicheskoj informacii NCBI eto besplatnyj onlajn arhiv soderzhashij bolee 6000 knig i dokumentov po estestvennym naukam i zdravoohraneniyu On beryot nachalo v 1999 godu s kollekcii disciplinarnyh uchebnikov i klyuchevyh tekstov po etim otraslyam Vposledstvii ona byla dopolnena sobraniem tematicheskih monografij v otkrytom dostupe Avtory redaktory sponsory i izdateli samostoyatelno predostavlyayut polnotekstovoe soderzhanie rabot v formate XML Eto dayot im ryad preimushestv glavnym iz kotoryh yavlyaetsya rasshirenie kruga potencialnyh chitatelej PubMed Central Osnovnaya statya PubMed Central PubMed ne predostavlyaet dostup k polnotekstovym versiyam rabot odnako soderzhit ssylki na PubMed Central PMC besplatnyj onlajn repozitorij nauchnyh issledovanij PMC byl osnovan v 1999 godu po iniciative direktora Nacionalnyh institutov zdravoohraneniya NIH Garolda Varmusa i zapushen v 2000 m Do sozdaniya PubMed Central issledovateli byli vynuzhdeny samostoyatelno iskat polnye versii rabot na sajtah izdatelstv Pri etom bolshinstvo iz takih publikacij byli skryty za pejvollom C poyavleniem onlajn repozitoriya polzovateli mogut napryamuyu poluchit polnotekstovye versii rabot esli oni vylozheny v otkrytom dostupe perejdya po ssylke iz PubMed V 2008 godu Nacionalnye instituty zdravoohraneniya obyavili o vnedrenii politiki otkrytogo dostupa Odnim iz eyo polozhenij stalo obyazatelnoe razmeshenie v PubMed Central kopij rabot opublikovannyh na granty NIH Na 2019 j god kollekciya PMC primerno na 88 sostoyala iz statej zhurnalov vhodyashih v bazy dannyh PubMed i na 12 iz otdelnyh statej popavshih pod mandat NIH Na iyun 2022 goda v PMC bylo arhivirovano bolee 8 mln rabot Otdelnye issledovateli kritikuyut integraciyu PubMed i PubMed Central za nalichie v poslednem publikacij iz hishnicheskih zhurnalov Tak issledovanie 2017 goda pokazalo chto bolee 10 hishnicheskih zhurnalov po nekotorym smezhnym disciplinam proindeksirovany v PubMed K aprelyu 2017 goda eti pokazateli uvelichilis do 23 7 dlya rabot v sfere reabilitacii 16 dlya nejronauk i 24 7 dlya nevrologii Drugie Takzhe v PubMed integrirovany citirovaniya iz takih unikalnyh baz dannyh kak HealthSTAR AIDSLINE HISTLINE SPACELINE BIOETHICSLINE PoiskPrimer poiskovogo zaprosa v PubMedPrincip raboty Domashnyaya stranica PubMed soderzhit prostoe okno poiska i giperssylki na rukovodstva instrumenty i drugie resursy Posle togo kak polzovatel vvodit vopros PubMed avtomaticheski utochnyaet ego cherez sistemu identifikacii MeSH Medical Subject Headings Eto pozvolyaet provodit naibolee tshatelnyj poisk po vsem materialam v svyazannyh bazah dannyh Zatem PubMed otobrazhaet poluchennye rezultaty Po umolchaniyu sistema sortiruet rezultaty po date dobavleniya v PubMed i predstavlyaet ih v svodnom formate s 20 rabotami na kazhdoj stranice Polzovatelyam dostupny nazvanie stati spisok avtorov istochnik informacii naprimer nazvanie zhurnala za kotorym sleduet data publikacii tom vypusk stranicy i unikalnyj nomer zapisi PubMed ili identifikator PubMed PMID Dlya statej na yazyke otlichnom ot anglijskogo zagolovok perevoditsya na anglijskij yazyk i pomeshaetsya v skobki V etom sluchae yazyk originala ukazyvaetsya v kachestve dopolnitelnoj zapisi Nazvanie zhurnala dlya kazhdoj zapisi otobrazhaetsya v sokrashyonnom vide Stranica rezultatov takzhe predostavlyaet polzovatelyu instrumenty i parametry dlya filtracii po tipu i date publikacii Esli kolichestvo vydannyh statej dostatochno veliko v pravom verhnem uglu stranicy otobrazhaetsya gistogramma illyustriruyushaya tendenciyu ih ispolzovaniya za poslednie gody Vse dannye mozhno zagruzit v formate CSV PubMed takzhe otobrazhaet abstrakt stati kontakty osnovnogo avtora ssylku na polnyj tekst i na svyazannye citirovaniya PubMed ne hranit polnye versii samih statej Odnako esli polnaya versiya raboty dostupna na sajte izdatelstva to sistema avtomaticheski generiruet na neyo ssylku dazhe esli statya skryta za pejvollom Esli polnotekstovaya versiya razmeshena v repozitorii PubMed Central ssylka na polnyj tekst poyavitsya pri otobrazhenii eyo annotacii v PubMed Indeksirovanie Osnovnaya statya Medical Subject Headings Dlya indeksirovaniya statej v PubMed integrirovana sistema Medical Subject Headings rus Medicinskie predmetnye zagolovki MeSH pozvolyaet sozdat standartnuyu slovarnuyu sistemu sposobstvuyushuyu effektivnomu poisku informacii Primerom mogut posluzhit slova telemedicina i telezdravoohranenie kotorye chasto ispolzuyut kak vzaimozamenyaemye Baza dannyh MeSH soderzhit kontroliruemyj slovar i indeksnye terminy Dostup k nej mozhno poluchit s domashnej stranicy PubMed V MeSH est tri osnovnyh ponyatiya predmetnye zagolovki deskriptory usloviya vvoda i podzagolovki kvalifikatory MeSH pozvolyaet borotsya s problemoj neposledovatelnoj terminologii v biomedicinskih rabotah kotoraya okazyvaet bolshoe vliyanie na tochnost zaprosov Sotrudniki NLM vruchnuyu identificiruyut terminy MeSH obychno 10 12 v kazhdoj postupayushej rabote Eto pozvolyaet predopredelyat terminy i integrirovat sinonimy Naprimer zapros serdechnyj pristup proindeksirovan v MeSH kak infarkt miokarda Posle togo kak polzovatel vvodit zapros PubMed avtomaticheski vklyuchaet alternativnye varianty napisaniya i terminy MeSH svyazannye s zaproshennym slovosochetaniem Ispolzovanie MeSH dlya poiska pozvolyaet sdelat ego bolee tochnym Terminy raspolozheny ierarhicheski po predmetnym kategoriyam Dlya rasshireniya ili suzheniya poiska polzovateli mogut samostoyatelno vybrat raspolozhennye vyshe ili nizhe v strukture terminy MeSH takzhe pozvolyaet sosredotochit poisk na konkretnyh voprosah rassmatrivaemoj temy naprimer ekonomicheskie aspektah telemediciny pri diabete Dlya etogo polzovatelyam neobhodimo snachala vypolnit poisk po slovu telemedicina no pered otpravkoj termina MeSH v konstruktor vybrat podzagolovok kvalifikator otmetiv sootvetstvuyushie flazhki Eto privedet k poyavleniyu kombinacii termina MeSH i podzagolovka v okne postroitelya poiska v dannom sluchae Telemedicina ekonomika Mesh Podzagolovki MeSH prisoedinyayutsya k predmetnomu zagolovku s pomoshyu kosoj cherty Poiskovyj zapros ostanetsya v okne postroitelya poiska chto pozvolyaet polzovatelyam dobavlyat k zaprosu drugie terminy Zatem poiskovyj zapros mozhet byt dopolnen terminom MeSH dlya diabeta to est Saharnyj diabet Mesh i kombinaciya etih dvuh terminov mozhet byt otpravlena dlya poiska v PubMed Etot metod znachitelno sokratit kolichestvo rezultatov po sravneniyu s ispolzovaniem termina MeSH bez kvalifikatora Odnako rezultaty budut bolee konkretnymi i sledovatelno bolee sootvetstvuyushimi zaprosu Interfejs Interfejs portala neskolko raz podvergalsya masshtabnym izmeneniyam V 2000 godu ego dizajn byl polnostyu izmenyon byli dobavleny filtry po yazyku i godam a takzhe funkciya prosmotra istorii poiska sohraneniya analiza i raspechatki vybrannyh citirovanij po odnomu ili neskolkim rezultatam poiska V nachale 2020 goda byla zapushena obnovlyonnaya versiya poluchivshaya neodnoznachnye otzyvy ot polzovatelej privykshih k staromu interfejsu Tri osnovnye funkcii Ispolzovanie PubMed Instrumenty PubMed i Dopolnitelnye resursy byli izmeneny na Obuchenie Najti Skachat i Issledovat Novaya versiya delaet upor na uskorennyj poisk informacii i bolee udobna v mobilnoj versii Takzhe byla dobavlena funkciya Rezultaty po godam chto pozvolyaet polzovatelyu otslezhivat tendencii ispolzovaniya Tip stati nalichie teksta vozrast i yazyk filtry yavlyayutsya odnimi iz populyarnyh instrumentov perenesyonnyh iz staroj versii PubMed InstrumentyaskMEDLINE askMEDLINE besplatnyj tekstovyj instrument poiska dlya MEDLINE PubMed On byl sozdan na osnove PICO angl Patient Intervention Comparison Outcome ili Pacient Vmeshatelstvo Sravnenie Rezultat metoda poiska po MEDLINE PubMed razrabotannogo dlya zanyatyh klinicistov zainteresovannyh v praktike dokazatelnoj mediciny no ne znakomyh s kontroliruemymi slovaryami kotorye mogli by sdelat poisk bolee effektivnym Polzovateli askMEDLINE mogut vvesti klinicheskij vopros razgovornym yazykom a poiskovaya sistema samostoyatelno najdyot sootvetstvuyushie zhurnalnye stati V osnove askMEDLINE lezhit mnogoetapnaya strategiya poiska Na pervoj stadii sintaksicheskij analizator ignoriruet znaki prepinaniya i udalyaet slova najdennye v spiske stop slov Zatem sintaksicheskij analizator PHP skript otpravlyaet izmenyonnyj zapros v E Utilities PubMed Entrez Fajl Extensible Markup Language XML vozvrashaemyj E Utilities ukazyvaet kategoriyu kazhdogo termina v zaprose Terminy pomechennye kak Vse polya oznachayut chto oni ne yavlyayutsya ni terminami medicinskih predmetnyh rubrik MeSH ni podzagolovkami MeSH Esli slovo Vse polya nahoditsya v rezervnom slovare ono ostaetsya v zaprose esli eto ne tak on udalyaetsya Ostalnye terminy otpravlyayutsya obratno v PubMed cherez E Utilities Esli chislo izvlechenij zhurnala posle pervogo raunda sostavlyaet ot 1 do 50 000 pervye 20 rezultatov otobrazhayutsya i poisk prekrashaetsya Poisk mozhet perejti ko vtoromu krugu esli v pervom raunde bylo ispolzovano slishkom mnogo filtrov v rezultate chego dostatochnoe kolichestvo rabot ne bylo najdeno ili esli chislo poiskovyh zaprosov v pervom raunde prevysilo 50 000 statej ukazanie na to chto poisk byl slishkom shirokim Tolko za pervyj god raboty askMEDLINE bylo polucheno bolee 15 000 zaprosov v osnovnom v vide voprosov ili slozhnyh fraz Samymi zaprashivaemymi byli voprosy po terapii My NCBI S 2010 goda polzovateli PubMed mogli sozdavat sobstvennye uchyotnye zapisi blagodarya funkcii My NCBI Personalizirovannyj podhod pozvolyal sohranyat relevantnye citirovaniya i poiskovye zaprosy zadavat unikalnye parametry poiska i nastraivat poiskovye opovesheniya a takzhe ispolzovat drugie dopolnitelnye parametry v PubMed S 1 iyunya 2021 goda uchyotnye zapisi NCBI perestali byt dostupny Polzovatelyam bylo predlozheno vhodit v sistemu cherez registraciyu na eRA Commons ORCID Google angl ili s pomoshyu uchyotnyh dannyh Einstein AD LinkOut LinkOut svyazyvaet PubMed s lyubymi vneshnimi po otnosheniyu k NCBI resursami Programma predostavlyaet polzovatelyam dostup k polnotekstovym versiyam statej raspolozhennyh na izdatelskih portalah Na iyun 2022 goda 4271 izdatelstva predostavlyali LinkOut dannye na regulyarnoj osnove PubCrawler PubMed integrirovan s veb servisom PubCrawler pozvolyayushim polzovatelyam sozdavat personalizirovannye veb stranicy Iznachalno PubCrawler sushestvoval kak Perl skript avtomaticheski otslezhivayushij novye rezultaty dlya predopredelyonnyh zaprosov v PubMed cherez poiskovuyu sistemu Entrez NCBI Odnako vskore ego sozdateli reshili sdelat ego otkrytym dlya drugih polzovatelej Posle registracii polzovateli mogut nastroit svoi zaprosy dlya PubMed cherez konfigurator PubCrawler Posle polucheniya rezultatov sistema avtomaticheski sravnivaet ih s predydushimi zaprosami polzovatelya ostaviv tolko neprosmotrennye raboty Takim obrazom servis pozvolyaet otslezhivat novye stati i rekomendacii PubCrawler takzhe dejstvuet kak sistema avtomaticheskogo opovesheniya otpravlyaya korotkie uvedomleniya ili elektronnye pisma s poslednimi obnovleniyami po mere ih dostupnosti PubMed Commons V 2013 godu NCBI zapustil pilotnuyu versiyu PubMed Commons Servis pozvolyal polzovatelyam publichno kommentirovat razmeshyonnye v baze dannyh abstrakty Sozdateli stremilis sozdat prostranstvo dlya diskussii o nauchnyh rabotah i takim obrazom borotsya s problemoj nevosproizvodimosti nauchnogo znaniya odnako usluga ne vyzvala azhiotazha sredi issledovatelej Nesmotrya na eto v 2015 godu sozdateli proekta prodlili finansirovanie PubMed Commons eshyo na god Odnako za etot period kommentarii byli ostavleny tolko k 6000 iz 28 mln statej i v 2018 godu bylo prinyato okonchatelnoe reshenie o prekrashenii raboty servisa Polzovatelyam bylo rekomendovano perehodit na analogichnuyu platformu PubPeer kotoraya pozvolyala kommentatoram ostavatsya anonimnymi PubMed Identifier PubMed Identifier ili PMID predstavlyaet soboj inventarnyj nomer ot 1 do 8 cifr dlya upravleniya zapisyami v PubMed Identifikator prisvaivayut kazhdoj indeksiruemoj v baze dannyh rabote za schyot chego lyuboe citirovanie mozhno najti s pomoshyu PMID S uvelicheniem kollekcii v 2012 godu bylo prinyato reshenie rasshirit identifikator PMID i dobavit desyatitysyachnuyu drob naprimer PMID 10097079 2 Do 2004 goda mnogie zapisi soderzhali unikalnyj identifikator MEDLINE v dopolnenie k PMID odnako vposledstvii ot nego reshili otkazatsya PubMed Mobile V 2012 godu vyshlo prilozhenie PubMed dlya iOS V 2015 godu dlya polzovatelej proveryayushih sajt s mobilnyh ustrojstv stala dostupna mobilnaya versiya PubMed Mobile Obnovlenie 2020 goda uluchshilo rabotu PubMed Mobile na ustrojstvah s portretnym sootnosheniem storon izobrazheniya VliyaniePubMed yavlyaetsya odnim iz vazhnejshih instrumentov poiska biomedicinskoj literatury ego sravnivayut s poiskovoj sistemoj Google dlya estestvennyh nauk Platforma predostavlyaet polzovatelyam besplatnyj dostup k baze dannyh citirovanij millionov nauchnyh publikacij prakticheski po vsem angloyazychnym biomedicinskim issledovaniyam Po dannym 2017 goda portal ezhednevno poseshali okolo 2 5 mln polzovatelej Chashe vsego PubMed ispolzuyut issledovateli i specialisty v sfere biomediciny i estestvennyh nauk Odnako predstaviteli shirokoj obshestvennosti mogut legko najti informaciyu o peredovyh issledovaniyah po lyuboj bolezni Vse proindeksirovannye v MEDLINE raboty sootvetstvuyut strogim kriteriyam poetomu izdateli bibliotekari i avtory ispolzuyut resurs dlya verifikacii kachestva svoih istochnikov PubMed sposobstvuet rasprostraneniyu principov otkrytoj nauki i svobodnogo dostupa k nauchnomu znaniyu Portal svyazan s PubMed Central pervym onlajn repozitoriem issledovatelskoj literatury V 2005 godu NIH vnedrila politiku obyazatelnogo predostavleniya recenziruemyh pervichnyh kopij v centralnuyu bazu dannyh PubMed Takim obrazom vse profinansirovannye gosudarstvom issledovaniya stanovyatsya dostupnymi dlya obshestvennosti Eto pomogaet praktikuyushim specialistam poluchat dostup k vazhnejshim materialam v ih oblasti i borotsya s pejvollami Otkrytyj dostup takzhe povyshaet veroyatnost citirovaniya raboty avtora Bazy dannyh PubMed chasto ispolzuyut i dlya analiza naukometrii Tak kommercheskaya firma Verum Analytics iz Konnektikuta razrabotala instrument analiza i uluchsheniya vosproizvodimosti rabot osnovannyj na izmerenii dannyh o statyah v kotoryh oni citiruyutsya PrimechaniyaFiorini N Lipman D Lu Z 10 7554 eLife 28801 Towards PubMed 2 0 eLife 2017 Michael Price They redesigned PubMed a beloved website It hasn t gone over well neopr Science 22 maya 2020 Data obrasheniya 19 iyunya 2022 21 maya 2022 goda PubMed neopr PubMed Data obrasheniya 28 iyunya 2022 30 iyunya 2022 goda Williamson 2019 Benson 1997 Lindberg 2000 Hunter 2006 pp 589 594 Gray 2013 Cross 2007 Canese 2013 J Ostell Entrez The NCBI Search and Discovery Engine International Conference on Data Integration in the Life Sciences 2012 Kent Anderson A Confusion of Journals What Is PubMed Now neopr The Scholarly Kitchen 7 sentyabrya 2017 Data obrasheniya 22 iyunya 2022 24 marta 2022 goda Hewitt A Mackey D Keep PubMed running at all costs Nature 2013 PubMed Help PMID PMID neopr National Center for Biotechnology Information Data obrasheniya 23 iyulya 2013 11 iyulya 2013 goda PubMed neopr PubMed Data obrasheniya 26 iyunya 2022 6 yanvarya 2022 goda Fitzpatrick 2008 OLDMEDLINE Citations Join PubMed neopr NLM Data obrasheniya 24 iyunya 2022 15 aprelya 2022 goda Lathrop 2018 Groote 2000 Eliot Marshall DOI 10 1126 science 286 5440 655a PNAS to Join PubMed Central On Condition Science 1999 Wadman M PubMed Central offers deal on content Nature 2001 Sequeira E McEntyre J amp Lipman D PubMed Central decentralized Nature 2001 Roberts 2001 pp 381 382 About PMC neopr PubMed Central Data obrasheniya 27 iyunya 2022 13 avgusta 2011 goda Manca 2017 Liz Pope PubMed Central The Serials Librarian 2001 Vanteru B C Shaik J S amp Yeasin M Semantically linking and browsing PubMed abstracts with gene ontology BMC Genomics 2008 T 10 vyp 9 30 iyunya 2022 goda Fatehi 2014 Constantino Carlos Reyes Aldasoro The proportion of cancer related entries in PubMed has increased considerably is cancer truly The Emperor of All Maladies Plos One 2017 T 12 vyp 3 30 iyunya 2022 goda Mette Sogaard P Andersen Henrik C Schonheyder Searching PubMed for studies on bacteremia bloodstream infection septicemia or whatever the best term is A note of caution American Journal of Infection Control 2012 T 40 vyp 3 Chapman 2009 PubMed The Basics Medical Subject Headings MeSH neopr Marshall Ketchum University Data obrasheniya 24 iyunya 2022 White 2020 Fontelo 2005 Fontelo P Liu F Ackerman M Schardt C M amp Keitz S A askMEDLINE a report on a year long experience Annual Symposium proceedings 2006 30 iyunya 2022 goda Searching PubMed My NCBI Accounts neopr University Libraries Data obrasheniya 24 iyunya 2022 16 aprelya 2021 goda PubMed Tips PubMed My NCBI neopr nedostupnaya ssylka istoriya Einstein Data obrasheniya 24 iyunya 2022 LinkOut Providers neopr NCBI Data obrasheniya 28 iyunya 2022 14 oktyabrya 2017 goda Kwan 2003 Hokamp K amp Wolfe K H PubCrawler keeping up comfortably with PubMed and GenBank Nucleic acids research 2004 Reardon S PubMed opens for comment Nature 2013 Collins F Tabak L Policy NIH plans to enhance reproducibility Nature 2014 PubMed shuts down its comments feature PubMed Commons neopr Retraction Watch Data obrasheniya 19 iyunya 2022 28 iyunya 2022 goda Elie Dolgin PubMed Commons closes its doors to comments neopr Nature 2 fevralya 2018 Data obrasheniya 20 iyunya 2022 17 iyunya 2022 goda PubMed Unique Identifier PMID neopr National Library of Medicine Data obrasheniya 24 iyunya 2022 27 aprelya 2019 goda Neil Versel PubMed mobile app far more popular than web neopr Mobi Health News 21 noyabrya 2013 Data obrasheniya 22 iyunya 2022 11 iyulya 2015 goda Megan von Isenburg neopr iMedical Apps 6 fevralya 2015 Data obrasheniya 22 iyunya 2022 13 iyunya 2021 goda Finding a Paper on PubMed Does Not Mean the Paper Is Any Good neopr McGill Data obrasheniya 28 iyunya 2022 2 iyunya 2022 goda David Beebe Public Access Success at PubMed Science 2006 30 iyunya 2022 goda Lu 2010 Michael Stebbinserica Davislucas Roylandand Gartrell White DOI 10 1126 science 313 5783 43b Public Access Failure at PubMed Science 2006 Dalmeet Singh Chawla Online tool calculates reproducibility scores of PubMed papers neopr Science 22 yanvarya 2018 Data obrasheniya 20 iyunya 2022 6 noyabrya 2021 goda LiteraturaCross J MEDLINE PubMed PubMed Central and the NLM angl Editor s Bulletin 2007 Vol 2 iss 1 doi 10 1080 17521740701702115 Fatehi F Gray L C Wootton R How to improve your PubMed MEDLINE searches 3 advanced searching MeSH and My NCBI angl Journal of Telemedicine and Telecare 2014 Vol 20 no 2 P 102 112 doi 10 1177 1357633X13519036 Fatehi F Gray L C Wootton R How to improve your PubMed MEDLINE searches 1 background and basic searching angl Journal of Telemedicine and Telecare 2013 Vol 19 no 8 P 479 486 doi 10 1177 1357633X13512061 Fitzpatrick R MEDLINE Old and New angl Medical Reference Services Quarterly 2008 Vol 17 no 1 P 49 60 doi 10 1300 J115V17N01 05 Fontelo P Liu F Ackerman M askMEDLINE a free text natural language query tool for MEDLINE PubMed angl BMC Med Inform Decis Mak 2005 Vol 5 no 5 P 479 486 doi 10 1186 1472 6947 5 5 Benson D Rapp B Vice President Launches PubMed Lauds Free MEDLINE Access angl NCBI News 1997 P 1 8 Canese K Weis S PubMed the bibliographic database angl The NCBI handbook 2013 Iss 1 Chapman D Advanced Search Features of PubMed angl Journal of the Canadian Academy of Child and Adolescent Psychiatry 2009 Vol 18 no 1 P 58 59 doi 10 1177 1357633X13519036 Sandy L De Groote PubMed Internet Grateful Med and Ovid angl Medical Reference Services Quarterly 2000 Iss 4 P 1 13 Hunter L Bretonnel K Biomedical Language Processing Perspective What s Beyond PubMed angl Molecular Cell 2006 Vol 21 no 1 P 589 594 doi 10 1016 j molcel 2006 02 012 Kwan K Chapter 17 LinkOut Linking to External Resources from Entrez Databases angl GenBank The Nucleotide Sequence Database 2003 Lathrop S Latterner M What it takes to get into Bookshelf angl Journal Article Tag Suite Conference JATS Con Proceedings 2018 2018 Lindberg D Internet Access to the National Library of Medicinen angl National library of mediicne 2000 Vol 4 P 7256 260 Manca A Cugusi L Dvir Z Deriu Z PubMed should raise the bar for journal inclusion angl Molecular Cell 2017 Vol 390 no 1 P 734 735 Ossom P W Exploring PubMed as a reliable resource for scholarly communications services angl J Med Libr Assoc 2019 Vol 107 no 1 P 16 29 doi 10 5195 jmla 2019 433 Richard J R PubMed Central The GenBank of the published literature angl PNAS 2001 Vol 98 no 1 P 381 382 White J PubMed 2 0 angl Medical Reference Services Quarterly 2020 Vol 39 no 4 P 382 387 doi 10 1080 02763869 2020 1826228 Zhiyong L PubMed and beyond a survey of web tools for searching biomedical literature angl Database 2010 P 1 13 doi 10 1093 database baq036 Ssylkipubmed gov Oficialnyj sajt PubMed
Вершина